本研究利用以PCR为基础的STS（Sequence-tagged site）和SCAR（Sequence characterized amplified region）技术对ThLr35及ThLr35的F₁代、F₂代进行检测，并对149个小麦品种进行分子标记分析鉴定，结果如下： 1．对STS、SCAR反应体系及反应程序中的一些重要参数优化选择，建立了适宜的小麦基因组STS、SCAR反应体系及程序：25μLPCR反应体系中基因组DNA 50ng，1×PCR缓冲液(Mg²⁺)，每个dNTP 0.2mM，Taq DNA聚合酶1.5U，每条引物25ng。扩增反应程序为：94℃，5min，一个循环；94℃，1min，52℃-STS 1min或60℃-SCAR 1min，72℃，2min，30个循环；10min，72℃延伸；4℃保存。 2．对ThLr35的F₁代植株进行PCR-STS和PCR-SCAR检测，扩增结果表明F₁代中有900bp的DNA片段，说明ThLr35的F₁代含有Lr35基因。F₂代中表现感病的植株没有900bp的DNA片段，表现抗病的植株有900bp的DNA片段。重复4次结果相同，进一步验证了与小麦抗叶锈基因Lr35紧密连锁的STS和SCAR标记的稳定可靠。 3．利用以PCR为基础的STS和SCAR分子标记技术，对149个小麦品种的叶锈抗病性进行分子分析，证明其中的8个小麦品种（6068，白蚰包，中麦9，早洋，碧玛1号，小偃7631，东方红3号，Madsen）含有Lr35基因。国际首次明确中国含Lr35基因的品种资源，为中国乃至世界培育成株抗病品种奠定了基础，提供了信息资源，同时该研究的成功为分子辅助选择在育种中的应用奠定了基础。 4．室内接种鉴定技术（叶锈菌株是对Lr35无毒力的99／5／16／5）证明这8个小麦品种在抗病表现上具有一定差异，其中东方红3号与其它品种差异较大。 5．将这8个小麦材料进行系谱分析，东方红3号的系谱组合是：农大45（农大17／小鹅186／早洋）选系，能明确东方红3号与早洋的亲缘关系，两者之间可能会存在抗病基因Lr35的遗传事实。其余6个小麦品种和这两个小麦品种彼此之间具体的关系，目前并不能从系谱上明确地确定。它们的抗性基因有可能是从斯卑尔脱山羊草中获得的。