相对于主板市场和中小板市场来说，创业板虽然年轻但凭借着独特魅力已成为了中国股票市场中不可或缺的一份子。在创业板快速发展的同时，质疑声也纷纷产生：家族控股普遍化，监管存在漏洞，实际控制人利用职权占有上市公司优良资源，破坏中小股东利益等等。各种治理问题接连出现，一些创业板企业因此频频亮起了红灯，严重威胁着创业板及中国资本市场的健康发展。创业板上市企业急需找到问题的根本，优化公司治理结构，才能稳定发展，提高绩效。本文从深圳创业板2010、2011年面板数据入手，筛选出具有完整数据的92家上市企业，以其为样本，首先对创业板上市公司治理结构中股权结构特点和董事会结构特点进行分析，探寻创业板上市公司治理结构特征及存在的隐患，然后以内生性的角度研究公司治理结构与公司绩效之间的关系，为促进我国创业板上市企业健康成长提供理论及实证支持。本文主要通过对创业板上市公司治理指标的特征分析以及公司治理指标与绩效的回归分析来进行实证研究，研究发现创业板上市公司普遍存在前十大股东持股比例及权利分布不均，家族控股严重，实际控制人通过董事会对公司进行绝对掌控，独立股东和股东大会的监督制约作用不强等特点。回归分析的主要结论：（1）企业绩效与股权集中度之间存在显著的非线性关系。（2）企业绩效与流通股比例显著正相关，而与法人股比例负相关。（3）企业绩效与董事会规模之间呈“U”型曲线关系。（4）两职分离以及独立董事人数比例对公司绩效具有正向影响。（5）董事会持股比例对公司绩效存在负面影响。以实证研究的结果为依据，为优化创业板上市公司治理结构，提高绩效，本文提出以下几点建议（1）改变董事会领导结构，由两职合一向两职分离转变。（2）增强董事会独立性，改善独立董事的激励制约机制。（3）适当减少董事会持股比例，增强股东大会对董事会的监督能力。