我国HIV感染者中整合素α4β7结合位点的分布

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目HIV-1感染建立及毒传播制HIV研究前沿和热点,整合素α4β7能与gp120特异性结合传递信号,结合位点V2环保三肽,促进毒感染、复制和传播。在中,性传播和注射吸毒要HIV感染者传播方式,性传播排在位还有增长。因研究整合素α4β7结合位点在HIV感染者中分布,以及整合素α4β7对性传播人选择具有重要意义。方法本实验样本选择四川凉山CRF07_BC异性传播和注射吸毒两组人阳性血浆样本,用巢式PCR扩增gp120V1-V5,查看整合素α4β7结合位点在CRF07_BC中分布,以及在异性传播和注射吸毒人中分布差异,通过熵值和非同义突变与同义突变比值(dN/dS)比较两组人序列差异,查看整合素α4β7对性传播人通过V2保三肽选择。通过邻接法、最大似法和贝叶斯方法构建系统进化树,查看序列分类和进化情况。结实验结到206条序列,其中异性传播人103条序列,吸毒注射人103条序列,在这两组人中有191条序列整合素α4β7结合位点LDI,占到总序列中92.7%。在吸毒注射人中三肽分布:93条LDI,5条LDV,2条LDM,1条PDI,1条VDV,1条LDL,香农指数为0.45。在异性传播人中分布为:98条LDI,1条LDV,1条LDM,1条PDI,1条TDI,1条VDI,香农指数为0.27,IDU人香农指数大于异性传播人,说明了IDU人α4β7结合位点多样性高。通过计算熵值,在体水平静脉吸毒人有6个位点熵值高于异性传播人,异性传播人有11个位点高于静脉吸毒人。异性传播人比起静脉吸毒人熵值要高,氨酸变异度更大。在整合素结合位点(29,30,31)三个氨酸中,IDU人熵值在氨酸31位点很高,两组人在该位点有显性差异,IDU人在该位点变异度大,异性传播人在该位点变异度小,说明了异性传播人在该位点进行了选择。在选择压力作用下在静脉吸毒人中有7个显性差异阳性选择位点,有25个显性差异阴性选择位点,异性传播人中有9个位点发生了显性差异阳性选择,有58个位点发生了显性差异阴性选择。体水平上异性传播人更多位点上进行选择。异性传播人在整合素α4β7结合每个氨酸dN/dS要比静脉注射人要低,以静脉注射人为对照,异性传播人在30位点和31位点发生了选择(P<0.05)。通过三种方式构建进化树可以确定了分析数据都CRF07_BC亚型,这些人之间没有相互传播关系。结论根据本实验研究可以出以下结论:整合素α4β7结合位点在CRF07_BC中分布以LDI为。在体水平上,异性传播人群在gp120上有更多位点进行选择。整合素α4β7对异性传播人具有选择性。本研究毒株最近共同祖先株印度C,最近祖先株起源时间1976年。
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