目前，高校大学生创业孵化器已成为高等学校实现技术创新、企业孵化、创业人才培育的创新创业实践基地。然而，由于我国高校大学生创业孵化器正处于起步与成长阶段，其管理工作不可避免的还存在一些问题，影响了孵化器的发展及功能的发挥，需要我们不断关注高校大学生创业孵化器的管理工作并进行理论与实践的探索。　　本研究以辽宁省三所不同层次、类型的高校大学生创业孵化器为调查对象，通过实地观察、获取管理文件以及访谈3名孵化器负责人以及12名孵化器中的学生，展开对三所高校大学生创业孵化器管理现状的调查。基于高校大学生创业孵化器的管理原则，结合科技部关于孵化器管理文件的要求，分析得出当前高校大学生创业孵化器还存在以下问题:第一，决策系统方面。组织结构不合理，管理部门责权不清;监控体系不健全，规章制度文件不全。第二，实施系统方面。申请项目存风险，缺少风险预防机制;管理理念不科学，服务质量观念薄弱;验收机制不健全，项目评估手段单一。第三，支持系统方面。导师管理部规范，缺乏激励考核机制;基金管理不到位，管理部门责权不清;文化建设存缺陷，创新氛围不够浓厚。　　本研究运用系统理论、全面质量管理理论并结合国家科技部的管理意见与高校大学生创业孵化器的现实情况，从改革管理体制、健全管理机制、加强全面质量管理三方提出对策:第一，改革管理体制。改革管理模式，实现行政化与企业化模式结合;创新组织结构，实行行政化与市场双重运作体系;健全管理制度，加强规章制度文件的执行力度。第二，健全管理机制。健全运行机制，实现运行机制的市场化;优化激励机制，推动利益主体孵化热情;完善约束机制，对各主体进行监督制约。第三，加强全面质量管理。树立全面质量管理理念，坚持以项目质量为中心;引进全面质量管理手段，提高孵化器的管理效率。