猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株M基因序列分析、原核表达研究及真核表达载体构建

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本研究以TGEV SC-Y株的毒种为材料扩增克隆M基因,并对其序列进行生物信息学分析;同时利用获得的M基因进行原核表达载体构建、表达及真核表达载体构建研究。主要研究结果如下: Ⅰ、参照GenBank中登录号AJ271965的TGEV基因序列,利用自行设计的一对引物,以ST细胞增殖培养的SC-Y株TGEV为材料,采用RT-PCR技术扩增出M基因,TA克隆构建获得其重组质粒pMD18-TrM。序列分析显示SC-Y株与GenBank中登录的TS、TFI、Purdue、Purdue-115、PUR46-MAD、96-133、HN2002、FS772/70、TO14株M基因核苷酸序列同源性达94%以上,氨基酸序列同源性达91%以上,表明不同毒株M基因保守性较高。M蛋白基因系统进化及其氨基酸同源性分析显示SC-Y株与美国Purdue株亲缘关系较近,同时研究发现我国TS、TFI株分别与韩国HN2002株、英国FS772/70株亲缘关系较近,而我国SC-Y、TS、TFI三株之间亲缘关系则较远,这从一定程度上说明我国TGEV可能为外国输入性。M蛋白氨基酸二级结构综合参数分析、信号肽及跨膜区预测显示,SC-Y株M前体蛋白存在有四个跨膜区(氨基酸残基位于1-16,53-75,86-104,113-135),其中1-16位为信号肽序列;成熟M蛋白(去除信号肽)为三个跨膜区,其N端位于病毒膜外区,而C端位于病毒膜内区。SC-Y株成熟M蛋白高级结构预测显示其功能结构域在N端主要集中于氨基酸残基8-21,该区域与M蛋白的生物学功能关系密切;预测综合分析显示可形成有效抗原表位的区域在N端氨基酸残基4-30或其附近。 Ⅱ、以pMD18-TrM为材料,扩增、TA克隆构建获得M蛋白去信号肽序列基因的重组质粒pMD18-TΔM。运用DNA技术,将pMD18-TrM、pMD18-TΔM中M蛋白基因及其去信号肽序列基因分别转移定向克隆到pET32a(+)中,获得重组原核表达载体pET32a(+)-rM、pET-32a(+)-ΔM。构建成功后分别转化高效表达菌株E.coli BL21(DE3)进行表达研究。SDS-PAGE电泳检测结果显示,原核重组表达载体pET32a(+)-rM未成功表达出预期目的融合蛋白Trx-M;原核重组表达载体pET-32a(+)-ΔM表达出预期融合目的蛋白Trx-ΔM,其表达量有待进一步研究;Western Blotting检测结果显示,表达的去信号肽目的融合蛋白Trx-ΔM具有特异的生物学免疫原性。
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