灰毡毛忍冬花管开裂相关基因ZFP-1全长克隆与表达分析

来源 :中南林业科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dashao1
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本文以灰毡毛忍冬花管为研究材料,在转录测序的基础上,应用RT-PCR和RACE技术分离得到一个具有锌指结构的基因ZFP-1,并对ZFP-1基因进行生物信息学分析、荧光定量表达等方面的研究分析,通过该基因在花器官发育不同时期的表达模式,推测该基因在花器官发育过程中起到调控作用,为灰毡毛忍冬花管开裂的分子调控机制进一步研究奠定了理论基础,为灰毡毛忍冬分子育种提供理论基础,本研究主要结果如下:(1)通过RT-PCR和RACE技术分离得到ZFP-1基因的全长cDNA序列,该基因全长1647bp,包括一个长度为1116bp的完整开放阅读框(ORF),3’非编码区长205bp、5’非编码区长326bp,编码371个氨基酸的蛋白质,在GenBank上登录号为KR013240。与其它物种相比,核苷酸序列比对发现该序列与梅花、碧桃、可可、苹果和柑橘的序列同源性分别为77%、77%、76%、76%和75%。(2)灰毡毛忍冬ZFP-1基因蛋白属于锌指蛋白基因家族中的一员,其N端具有一个115个左右氨基酸的BTB/POZ结构域,C端有一个zf-TAZ锌指结构,与其它物种相比,氨基酸序列比对发现该序列与可可ZFP氨基酸序列同源性高达75%,与葡萄ZFP氨基酸序列同源性为74%。(3)ZFP-1基因编码的蛋白质推测其分子量为4.28kD,理论等电点为9.18。20种基本氨基酸全部都有出现,其中,非极性氨基酸占总氨基酸的46.1%,不带电荷的极性氨基酸占总氨基酸的24.5%,带正点(碱性)的氨基酸占总氨基酸的18.1%,带负点(酸性)氨基酸占总氨基酸的11.3%。整体上看,ZFP-1蛋白中极性氨基酸数量略高于非极性氨基酸的数量。由此可以推测,ZFP-1蛋白为亲水性蛋白。(4)ZFP-1基因编码的蛋白质二级结构以卷曲和螺旋结构为主,在接近N端的位置存在一个跨膜结构,位于104~122氨基酸处,长度为19个氨基酸,另外还存在一个信号肽序列,位于1~70氨基酸处。(5) qRT-PCR分析表明,ZFP-1基因在‘普通灰毡毛忍冬’花管中表达量极低,几乎不表达,在‘金翠蕾’的花管中高度表达,并随着花器官的发育该基因的相对表达量呈明显上升趋势。
其他文献
石敬瑭(892—942)建立的后晋王朝(936—947)存在了不过11年,而他本人在位也不过6年,却因为割让"燕云十六州"一事,挨了一世的骂名。我们究竟该如何评价石敬瑭,其实牵涉到历史
量子关联是量子信息处理的重要资源,然而系统与环境相互作用时,系统不可避免地发生退相干效应,出现量子关联损失甚至突然死亡现象。由于环境具有记忆效应,通常可以利用非马尔
大地水准面的精化与高程转换是现代控制测量的基础内容,高程转换是实现测绘信息资源共享和大地基准精化至关重要的环节。目前GNSS高程转换实际运用的方法有重力测量法和传统
本文介绍了四种求解非线性偏微分方程(简称NLPDE)的有效方法,分别是Lie对称方法、推广的简单方程方法、推广的Tanh函数法和同伦摄动法,并重点探索了Lie对称方法与其余三种构
背景进入21世纪随着人类基因组计划的开展,越来越多的科学家开始投入到基因组学的研究之中,基因学家用了多种多样的方法去鉴定基因复杂的特性,这些方法的共同特点是研究团队
随着数论研究的不断发展,出现了形式各样未解决的数论问题,众多未解决的数论问题吸引着数论专家与数论爱好者的研究.本文利用初等方法和解析方法研究了两种类型Diophantine方
本篇论文给出了第一类典型域上加权Bloch空间βp(RI,(m,n)),p≥0的一个新的定义,并证明了范数||f||1,p和||f||2,p的等价性.本文主要研究了从βp(RI,(m,n))到βq(RI,(m,n))的
图的强迫问题出现在各种子结构及相关应用问题中,如:完美匹配,控制集和染色等.设M是图G的一个完美匹配.如果S(?)M且G的其它完美匹配都不包含S,那么S叫做M的一个强迫集,其最小
长期涨落性和持续性是宏观经济变量的两个典型特征,并且经常与单位根问题联系起来Johansen和Lange(2013)一文中提出了一个简单的一阶随机系数自回归(RCA(1))时间序列模型,当
中微子物理是目前粒子物理和宇宙学的研究热点之一,它是突破标准模型并发现新物理的关键,中微子振荡对解释正反物质不对称及宇宙起源等问题具有重要意义。θ13是中微子振荡的