行政组织掌握着国家最重要的政治权力,在社会政治生活和公共治理中具有核心地位。行政组织能否对社会和公民实现一种良好的治理是衡量一国社会管理水平和综合国力的重要标准。行政组织的治理能力直接关系到经济的正常运行和社会的和谐稳定,甚至还影响到行政组织在人民群众中的威信和形象。行政组织的变革是一个动态的过程,市场经济的深入发展、民主政治的向前推进、人民群众需求的日益提高,以及全球化和信息化的冲击,使得行政组织必然会面临新的挑战,必须通过变革的推进而不断的完善和发展。2010年党的十七届五中全会强调积极稳妥推进政治体制改革,再次为行政组织的变革吹响了号角。鉴于此,在现阶段研究我国行政组织的变革问题就显得尤为重要和迫切。本文通过以治理理论作为我国行政组织变革的理论基础,着重从我国行政组织的治理环境、治理结构、治理机制三个方面来阐述我国行政组织目前存在的缺陷,并提供我国行政组织变革的基本思路,以期为政策制定者提供可供参考的意见和建议,促进我国行政组织的不断完善与发展。根据研究需要,本文按照提出问题、分析问题、解决问题的逻辑思路展开,共分为四大部分：第一部分为绪论。介绍了基于治理理论的行政组织变革这个课题的研究背景和意义,简要综述目前国内外关于治理理论和行政组织的研究动态,并列明本文的研究方法和结构安排。第二部分为治理视角的行政组织分析框架。旨在为全文提供理论基础,即对本文的研究对象给与严格界定,对治理和行政组织的相关理论进行了概述,最后阐述了行政组织治理的分析框架。第三部分为我国行政组织治理缺陷分析。从对我国行政组织的治理环境、治理结构和治理机制三个方面来阐述行政组织的缺陷并分析其原因。第四部分为我国行政组织治理变革的基本思路。根据中国国情和实际发展需要,提出我国行政组织治理变革的思路与框架,并设计较为有效的具体对策措施,提出了合理设计行政组织的治理结构、建立有效的行政组织治理机制和不断完善行政组织的治理环境的行政组织治理变革的基本思路。