由于农业的特殊性和基础性,世界各国从国民经济发展全局出发,纷纷制定各种政策措施,对农业实施干预和支持。我国是一个农业大国,农业基础薄弱,“三农”问题对经济社会发展的制约作用日益凸现,亟需解决,解决“三农”问题的关键在于政府的重视和支持。党的十六届四中全会以来,党中央、国务院审时度势,从构建社会主义和谐社会全局出发,提出了把解决好“三农”问题作为全党工作重中之重的基本要求,制定了“工业反哺农业、城市支持农村”和“多予、少取、放活”的基本方针,规划了建设社会主义新农村的基本任务。各级政府按照“存量适度调整、增量重点倾斜”的原则不断增加对农业的投入,完善对农民增收减负政策,进一步扩大公共财政覆盖农村的范围。审视我国财政支农资金管理现状,尚存在不少问题,这些问题直接影响到财政支农效果,使本来就极为有限的支农资金低效运行甚至白白浪费。可见,加强财政支农资金管理、提高资金管理绩效迫切需要思考和研究,这将具有直接的现实意义。本文结合实际,首先指出了财政支农资金运行过程中资金损耗较大、资金内部控制办法不完善、外部监督乏力、资金管理绩效评价机制不健全等问题；然后分析了财政支农资金管理问题的主要原因；最后提出以下建议：(1)在审计部门内部设立财政支农资金审计专门科室,让社会审计机构参与到财政资金支农领域的审计,以增强审计的独立性、监督的立体性和审计再监督功能；(2)整合财政支农资金,发挥资金的集约化效益；(3)完善财政支出管理制度,扩大财政直接支付的资金范围；(4)在项目实施过程中应加强项目申报、项目实施和项目的绩效评价与后续管理等全过程的管理控制；(5)用平衡记分卡对财政支农资金管理绩效进行评价。以期通过以上措施,改善财政支农资金管理绩效,用有限的财政支农资金更好更快地建设社会主义新农村。