水貂α,β-干扰素基因的克隆、表达与遗传进化分析

来源 :山东农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhrwudi
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干扰素(Interferon,IFN)是一类由细胞分泌的,至少在同种细胞上具有广谱抗病毒、抗细胞分裂、免疫调节活性和在不同途径上影响细胞的代谢、生长和分化的蛋白质。目前已有商品化的猪、鸡、犬等重组干扰素产品在市场上应用,但是水貂干扰素国外还未见相关报道。国内仅中国农业科学院特产研究所野生动物人兽共患病研究室应用RT-PCR方法从体外诱导的水貂外周血淋巴细胞中扩增出水貂的α干扰素13种基因(MiIFN-α)亚型,其他还未见相关报道。近几年我国毛皮动物产业发展较迅速,是国际上少数毛皮动物养殖业发达的国家之一,尤其在吉林、辽宁、黑龙江、河北、山东、内蒙古等地区,养殖水貂已成为当地农民增收致富的主要途径,目前水貂存栏量达3000万只,毛皮动物产业是我国农村产业结构调整的重要产业。近年来,貂、狐狸、貉等犬科动物作为特种经济动物饲养正在兴起,而犬科动物各种病毒性疾病是造成死亡的最重要原因。干扰素对病毒具有广谱、特效的抗病毒感染作用。所以,为进行犬科动物干扰素制剂的研究,我将从以下几个方面进行研究,为重组水貂干扰素的开发奠定了基础,并且分析针对一种犬科动物的干扰素是否适用于所有犬科动物,为临床治疗及饲养管理提供指导。   1.根据GenBank上发表的雪貂IFN-α基因(EU863613.1),雪貂IFN-β基因(EF581890.1)cDNA全序列,在阅读框外侧两端保守区分别设计一对引物;直接从脾脏组织中提取总RNA,反转录后以cDNA作为模板扩增IFN-α和IFN-β基因,获得了MiIFN-α基因和MiIFN-β全长基因,MiIFN-α长度为564bp;MiIFN-β基因全长为561bp。将水貂IFN-α基因序列与GenBank上收录的雪貂(EU863613.1)核苷酸同源性为94.3%,氨基酸同源性为89.3%;与雪貂(EU863614.1)核苷酸同源性为95.0%,氨基酸同源性为90.9%;与雪貂(EU863615.1)核苷酸同源性为95.5%,氨基酸同源性为91.4%。水貂IFN-β基因序列与GenBank上收录的雪貂(EF581890.1)核苷酸同源性为100.0%,氨基酸同源性为100.0%;与雪貂(EF368208.1)核苷酸同源性为98.2%,氨基酸同源性为98.4%。另外,将扩增的基因序列与犬、貉、赤狐、大熊猫进行基因序列比对,发现MiIFN-α核苷酸序列同源性78.1%-99.3%之间。氨基酸同源性在66.3%-98.4%之间。犬和赤狐的IFN-α亲缘关系最近(同源性接近98.0%),犬和貉的IFN-α亲缘关系也比较近(同源性达98.0%),而水貂和赤狐、貉、犬的亲缘关系相对较远(基因同源性79.1%左右,氨基酸同源性66.3%~67.9%)。MiIFN-β核苷酸序列同源性在83.0%~100.0%之间,氨基酸同源性在69.4%-100.0%。水貂与雪貂、犬与赤狐的IFN-β亲缘关系最近(同源性为100.0%),犬和貉的IFN-β亲缘关系也比较近(同源性达98.4%),而水貂和赤狐、貉、犬的亲缘关系相对较远(基因同源性86.0%左右,氨基酸同源性73.7%~75.3%)。   2.以MiIFN-α全长基因序列和MiIFN-β全长基因序列为模板,根据表达载体的酶切位点设计成熟肽基因表达引物,目的基因亚克隆入PET32a-MiIFNα、PET32a-MiIFNβ原核表达载体,在大肠杆菌中进行表达。表达产物SDS-PAGE分析,两种重组干扰素目的蛋白均以包涵体的形式存在,MiIFN-α重组蛋白大小约为42KDa;MiIFN-β重组蛋白大小约为43KDa。
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