作为国家创新体系的中间力量,高校不仅需要为国家建设提供坚实的知识基础、人才资源和科技支撑,还必须具有可持续发展的能力,不断地为国家提高科研创新能力和创新精神。对高校的科研绩效进行评价,不仅可以促进高校科研的自我发展,自我完善,而且可以优化资源配置,对于建立健全我国的科研创新体系,意义重大。本文研究了高校科研绩效评价领域的研究现状,通过对科研绩效内涵的分析,以科学合理为原则,引入群组决策的概念,将一组判断矩阵扩大到m组判断矩阵,设计了高校科研绩效评价指标体系;通过对各种常用评价模型和评价方法的优缺点分析,提出基于主成分BP神经网络的科研绩效评价方法,该方法主要针对指标众多的指标体系,可以在保留大量指标的基础上,完成评价工作;在完成评价工作的基础上,本文采用了基于聚类的分组方式,将各高校按照结果差异性的大小分到不同的分组内,各组内的成员差异性较小,组间成员的差异性显著,由此避免了绝对排名带来的缺陷。在上述理论研究的基础上,设计实现了高校科研绩效评价系统,完成了各种功能需求,并通过部分高校数据,进行了评价方法和提升方法的实证分析,验证了方法的有效性。