“三农”问题和知识产权保护问题是当前我国各级政府、学术团体、经济组织等社会各界的关注焦点。以现有的优势资源为基础,加强科技创新和知识产权保护,生产一批具有市场竞争力的产品,是实现农民增收、农业产业结构调整和农村经济发展的重要途径。然而,对于“三农”问题和知识产权保护这两个议题的交集部分,一方面理论研究显得略微薄弱,另一方面实践操作中也存在诸多漏洞和不足,从而影响了城乡一体化的协调发展。本文是知识产权制度对“三农”问题影响的实证调查研究。作为一种珍贵的中草药资源,济源冬凌草是我国众多优势资源中的一个典型,其开发与利用中的知识产权保护问题也具有一定的代表意义。根据实地调查所得资料和相关理论,文章首先分析了济源冬凌草在产业化利用过程中出现的问题,即冬凌草相关产品的市场认同度和附加值不高。同时,通过对冬凌草遗传资源保护、专利保护、地理标志保护、商标保护等现有方式的分析,归纳了冬凌草产业开发中知识产权保护方式的不足,即法律制度不完善、政府角色不到位、企业创新力不高、产业利润分布不合理、以及遗传资源保护工作不力等。针对这些问题,文章构建了对济源冬凌草的知识产权保护体系,即以冬凌草遗传资源的保护为线索,以专利保护为主体,以商标和地理标志制度为支撑,以商业秘密和著作权保护为补充,其他保护方式协调运作,产学研合作创新,各种保护方式综合运用,相关主体公平公正获得惠益的知识产权保护体系。