着丝粒蛋白CENP-LN识别CENP-A核小体的结构机与功能研究和金黄色葡萄球菌Pfk的结构与功能研究

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在有丝分裂的过程中,偶联的姐妹染色单体准确平均分配到两个子细胞中,完成遗传物质的传递,对于维持遗传稳定性和物种连续性至关重要。姐妹染色单体的平均分离主要依赖于动粒在着丝粒区的组装。着丝粒是染色质上一段结构和功能都高度特化的区域,在该区域H3被其变体CENP-A所替代。动粒是在着丝粒区组装的一个大的蛋白复合体,负责为姐妹染色单体与纺锤体微管的连接建立承载区。动粒主要包括:内层CCAN蛋白质网络和外层KMN蛋白质网络。CCAN蛋白网络又可划分成五组亚复合物:CENP-C、CENP-LN、CENP-HIKM、CENP-TWSX和CENP-OPQUR。其中,CENP-N能够特异性识别CENP-A核小体,招募CENP-L,完成CENP-A所携带遗传信息的解码和起始动粒蛋白的招募。在本文第一篇中,我们解析了 CENP-LN/CENP-A-NCP复合物的冷冻电镜结构,整体分辨率为5.8A。CENP-N通过其C端约100个氨基酸与CENP-L相互作用,形成一个异二聚体,与溶液中聚集状态相吻合;通过其N端约200个氨基酸与CENP-A核小体直接相互作用,其中,CENP-AL1loop上的R80、G81和D83对CENP-N特异性识别CENP-A核小体具有重要作用,另外,CENP-N氨基端的碱性氨基酸还可以与核小体DNA上的四个位点的磷酸骨架直接相互作用,进一步稳定两者的结合。DNA上的这四个位点分别为:第+37/+36位核苷酸、第-32/-31位核苷酸、第+26/+25位核苷酸和第-22/-21位核苷酸。我们通过体外结合实验验证了 CENP-N上与DNA结合的关键氨基酸残基有K10A、R11A、R44A和H77A。在体内,与DNA相互作用的关键氨基酸位点的突变,显著减弱了 CENP-N自身及CENP-L等动粒蛋白的定位,说明CENP-N与核小体DNA的结合,对CENP-N在动粒上的定位和其他动粒蛋白的招募至关重要。而且,在不同物种中,为了维持这种“解码”机制的保守性,CENP-N可与CENP-A共同进化。糖酵解过程是所有生物体进行葡萄糖代谢产生ATP供能的必经阶段。在糖酵解过程中,己糖激酶、磷酸果糖激酶、丙酮酸激酶被认为是关键酶,有它们催化的反应是不可逆的。其中,磷酸果糖激酶的催化效率较低,是最为重要的调控关键酶,功能单位为四聚体,以ATP为磷酸供体,催化F6P转变为FBP,并产生一分子ADP。它是一种经典的别构酶,通过R-state和T-state的构象转变来调节自身的催化活性。在本文的第二篇中,我们利用E.coli表达了金黄色葡萄球菌的Pfk,它在溶液中存在二聚体和四聚体两种状态,且蛋白浓度越高四聚体越多,而且这种四聚体状态可以被低pH,或ADP,或ATP,或AMP-PNP诱导解离为二聚体形式,但是也可以被其底物F6P所稳定。我们通过解析Pfk及其与不同配体复合物的结构发现::Sa_Pfk、Sa_Pfk/ADP、Sa_Pfk/ATP 和 Sa_Pfk/AMP-PNP 的结构为二聚体,Sa_Pfk/F6P和Sa_Pfk/F6P/AMP-PNP的结构为四聚体。通过结构分析,我们认为Sa_Pfk所特有的G150-L151 motif的柔性赋予了 α7-helix“开关”的功能,在F6P的协同作用下,调节自身二聚体-四聚体间的转换,从而调控酶的催化活性。
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