膀胱癌顺铂耐药与其基因甲基化相关性研究

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目的:通过了解顺铂耐药膀胱癌细胞中DNA甲基化谱的改变,探索与发生顺铂耐药密切相关的基因的甲基化及其蛋白表达的变化,为阐明膀胱癌化疗耐药机制提供新的实验依据。方法:(1)顺铂耐药膀胱癌细胞株的建立:利用顺铂浓度梯度递增法(0.2-2.0mg/L),在T24膀胱癌细胞中建立顺铂耐受的细胞株亚型(T24/DDP),并对细胞的各项生物学指标进行检测,包括顺铂敏感性、细胞形态学、细胞生长曲线及细胞周期等。(2)顺铂耐药膀胱癌细胞DNA甲基化谱分析与耐药相关甲基化基因的筛选:DNA甲基化芯片对T24及T24/DDP细胞基因组的DNA甲基化谱进行分析,并通过统计学方法,筛选高甲基化,及低甲基化修饰基因。利用real time-PCR方法对筛选出的具有表达差异的甲基化修饰基因进行分析,并结合文献资料,最终采用MSP法,对筛选出的甲基化修饰基因进行进一步的验证分析。(3)通过5-氮杂-2-脱氧核苷去甲基化了解顺铂耐药膀胱癌细胞生物学的作用;并对细胞生物学指标进行检测。(4)采用5-氮杂-2-脱氧核苷去甲基化了解逆转顺铂耐药膀胱癌细胞的分子机制:利用real time-PCR及western blot方法,对T24/DDP及经5-氮杂-2-脱氧核苷去甲基化处理T24/DDP细胞中关键基因及其蛋白的表达进行分析。结果:(1)成功建立顺铂耐药的膀胱癌细胞(T24/DDP): DDP敏感性实验表明,在20ug/ml浓度的DDP处理下,T24细胞死亡率接近100%,而同样浓度下顺铂耐受的细胞株亚型T24/DDP细胞的死亡率则是30%。细胞生长曲线表明,T24与T24/DDP细胞的倍增时间分别为72.5和90.2小时。细胞形态学观察表明,T24与T24/DDP细胞形态学无明显差异。细胞周期分析表明,T24/DDP细胞中G0/G1期细胞比例显著增加,G2/M期细胞下降。(2)顺铂耐药膀胱癌细胞DNA甲基化差异基因筛选:利用DNA甲基化谱芯片对T24及T24/DDP两个细胞系的基因组DNA甲基化谱进行分析,发现1120个甲基化差异位点;并筛选出40个高甲基化,18个低甲基化修饰基因。然后通过realtime-PCR方法对该58个差异甲基化修饰基因的表达进行了分析,发现其中30个基因的表达有统计学差异。结合文献资料,又筛选出和本研究相关基因20个,采用MSP法,对这些基因的甲基化修饰在细胞水平上又进行了验证分析,最终筛选出与甲基化谱芯片结果一致的15种基因,包括14种高甲基化和1种低甲基化修饰基因。(3)5-氮杂-2-脱氧核苷去甲基化对顺铂耐药膀胱癌细胞的生物学作用:经去甲基化处理后,之前发现的14种高甲基化修饰差异基因中的7种基因的高甲基化修饰被改变:ABCC6, CCNA1, HPP1, ITGA4, RASSF1A, RUNX3,TMS1。同时去甲基化处理后,T24/DDP细胞对于顺铂的敏感性显著提高、细胞凋亡比例增加、S期细胞比例显著增加。(4)5-氮杂-2-脱氧核苷去甲基化逆转顺铂耐药膀胱癌细胞的分子机制研究:利用real time-PCR和western blot方法的分析结果表明,上述7种基因(ABCC6,CCNA1, HPP1, ITGA4, RASSF1A, RUNX3,TMS1),经5-氮杂-2-脱氧核苷去甲基化处理后,其mRNA及蛋白的表达水平显著增加。结论:(1)顺铂浓度梯度递增法所建立的T24/DDP细胞株对顺铂具有很好的耐受性,可以作为体外模型用于顺铂耐药机制的研究。(2)膀胱癌细胞发生顺铂耐药时,细胞基因组存在广泛的DNA甲基化修饰改变。(3)5μM5-氮杂-2-脱氧核苷处理T24/DDP细胞,能使部分高甲基化修饰基因发生去甲基化,而提高T24/DDP细胞对于顺铂的敏感性。(4)ABCC6, CCNA1, HPP1, ITGA4, RASSF1A, RUNX3,TMS1等7种基因的甲基化修饰可能在介导顺铂耐受作用机制中发挥重要作用。
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