随着新技术浪潮席卷全球，各国都将培育自主技术创新视作发展国家核心竞争力的重点。而高技术产业作为知识密集型产业和国家级战略产业，其承载了自主技术创新的重要使命。自上世纪90年代以来，外商直接投资（FDI）源源不断地流入我国，至今我国已经成为世界上吸引外资最多的发展中国家，而高技术领域是外商投资的重点领域之一。2006年，我国开始实行创新型国家战略，将自主技术创新作为国家发展战略核心，同时将高技术产业扶植成为国家自主技术创新的重点领域之一。由此可见，高技术产业的自主技术创新能力是我国未来经济发展的核心竞争力。本文在消化吸收国内外学者的研究成果的基础上，重点分析了FDI对高技术产业自主技术创新的作用机制以及影响因素，并且分析了FDI对我国高技术产业发展影响以及自主技术创新的现状。在进行现状分析的基础上，采用数量分析。本文利用了高技术产业中19个行业中2002-2011年的面板数据研究了外商直接投资对我国企业自主技术创新能力的影响。结果表明，外资企业的研究经费投入对国内企业产生了正向的示范作用，然而其带来的负向的竞争效应抵消外资企业对内资企业自主技术创新能力的正面影响。外资企业技术引进费用对内资企业的自主技术创新能力有不显著的积极作用。另一方面，内资企业的技术研发经费以及平均规模均对自身的自主技术创新能力有正面的影响。由此得出结论，在提高企业消化吸收先进技术能力的基础上，发展自主技术创新能力需要国内内资企业不断地增加自主研发经费同时应该扩大自身企业的经营规模。