要有效解决“三农”问题,必须大力发展农产品加工业,提高农业整体效益。大力发展农产品加工业的有效途径之一就是实施农产品供应链管理,事实也证明农产品供应链能够使参与的各企业获得比原来高得多的效益,然而农产品供应链由于其内在的特殊性以及联结了农工商三大产业,不稳定因素呈全方位性,受到自然、社会、制度、市场、组织、价格、行为等因素的影响和作用。这些影响因素呈现很强的扰动性和破坏性,很容易造成农产品供应链合作关系的解体从而给农产品供应链带来巨大的危害。因此对于农产品供应链合作稳定性的研究具有较大的现实意义。本文首先从分析供应链概念出发,给出了农产品供应链的定义,以及着重分析了农产品供应链的特征。其次借鉴生物学和物理学上关于稳定的定义,提出了农产品供应链合作稳定性的定义,根据产生的原因对影响农产品供应链的合作稳定性因素进行分类,主要分析了外生和内生两种不稳定因素；接下来在运用灰色系统理论对农产品供应链合作稳定性进行综合评价,给出了衡量农产品供应链合作稳定性的计算方法与实例,为农产品供应链合作稳定性的管理提供了参考,具有一定的理论价值与实践意义。最后提出了以农产品供应链中的核心企业为主导,通过建立良好的利益分配机制和基于过程的信任机制来维持农产品供应链合作稳定性。