水稻种子耐淹成苗相关性状QTL定位研究

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在直播稻生产中,种子在萌发和成苗期常会遭受淹水胁迫而导致减产,因此,探究淹水胁迫下水稻种子耐淹萌发及成苗性状对直播稻增产有重要作用。本研究利用6份材料从生理生化角度解析低氧萌发性状,并结合高密度遗传图谱对包含275个株系的CHA-1/H335的RIL群体开展水稻种子耐淹相关性状QTL定位研究。主要研究结果如下:(1)6份材料在淹水萌发期测定的可溶性蛋白含量、SOD、POD、CAT和AMS酶活性随缺氧时间的增长变化趋势各不相同,无明显规律,但SOD和POD酶活性变化趋势大致相同。(2)在10 cm淹水条件下,CHA-1/H335的RIL群体F6和F7世代定位到耐淹相关QTL共33个,其中耐淹萌发期定位到21个,耐淹芽期12个。分布于第2、3、4、6、7、8、和第10号染色体,通过比对物理位置发现共有19个QTL位点,其中有6个与前人定位在相同或邻近区域,余下13个还未见报道。(3)q SSD-2、q CD-4-1、q CSA-8和q CV-8在两个环境中都能被定位到,其中,q CSA-8和q CV-8的表型贡献率分别为4.41~4.80%和4.09~4.97%,且这两个QTL在同一个位点上,该位点同时控制芽鞘表面积和体积,具有重要研究价值。这些QTL的表达较为稳定,对环境影响不敏感,对于水稻直播育种具有重要的参考价值。(4)共有9个位点表现出QTL位点的多效性,其中的4个未见报道,是新的QTL位点。在第2号染色体上的Block3943-3970和Block3988-3998同时定位到控制淹水萌发期和芽期的QTL(Block3943-3970定位到q CD-2-1和q SSD-2,Block3988-3998定位到q CD-2-2和q SFW-2),表型贡献率分别为6.77~10.89%和7.46~11.28%,这两个位点对耐淹萌发期和芽期都存在影响;在第10号染色体上Block16658-16661的QTL位点同时控制芽长(q SH-10)和根表面积(q RSA-10),表型贡献率分别为5.68%和4.05%。该位点同时控制地上部和地下部,具有重要研究价值,可继续进行后续研究。综上,本研究对水稻种子耐淹成苗性状的遗传表现进行解析,利用GBS技术构建高密度遗传图谱,并鉴定出一批尚未报道的重要QTL。为后期培育水稻耐淹品种提供基础用于聚合育种实践,对于提升直播稻育种具有较强的理论和实践意义。
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