遗传多样性是生物多样性的重要组成部分，是生态系统多样性、物种多样性和维持物种长期存在的基础。 本研究参考相关文献设计引物，寡聚核苷酸序列为，上游引物：5-gCg，AAT，TCA，TCC，CAC，gTg,CCT，gC-3，下游引物：5-gAg，AAT，TCC，Tgg，ggA，ggg，ACC，TT-3。经68℃退火及30轮循环的PCR程序后分别克隆了来自我国青海、云南和甘肃地区牦牛乳球蛋白基因的5调控区1447bp的DNA片段，将该片段从琼脂糖凝胶中回收，克隆在pMD18-TVector后进行序列测定。 序列分析结果表明青海牦牛β-乳球蛋白5调控区序列与奶牛的序列相比有34个碱基的差异，核苷酸序列同源性为97.65％，其中明显的差异表现在一个位点连续三个碱基的缺失突变和一个位点一个碱基的插入突变。云南牦牛乳球蛋白基因5调控区序列与奶牛的序列相比有38个碱基的差异，两者之间的同源性为97.3％。其中也包含有一个位点连续三个碱基的缺失突变和一个位点一个碱基的插入突变。青海牦牛和云南牦牛乳球蛋白基因相比，有8个碱基的差异，两者之间的同源性为99.4％。