“十二五”规划，我国将新修建56座机场，迁建机场16座，改（扩）建机场91座，这些机场将主要分布在我国中西部地区。由于我国中西部地区地理环境较为复杂，给机场选址工作带来了实际困难。而选址的优劣直接影响机场的建设费用和建成之后的运行安全和运行效率。飞行程序设计是选址阶段的重要工作，主要包括设计机场的进离场程序和进近复飞程序、划设保护区并对障碍物进行评估，根据障碍物评估结果对机场场址进行调整优化，进而达到较为理想的场址。然而目前选址阶段的飞行程序设计主要是利用Auto CAD软件基于扫描的纸质地图及实测障碍物数据为依据进行设计，不能自动化的对障碍物进行评估和直观的显示障碍物与保护区的实际情况。因此本文针对这些问题，着重对障碍物的自动化评估和GIS中保护区的划设以及保护区与障碍物关系的三维显示进行了研究，最终开发了机场选址阶段飞行程序辅助决策系统。本文首先分析了机场选址阶段飞行程序设计的国内外现状，其次对目前常用的GIS软件在机场选址阶段飞行程序设计中的特点和优势进行了分析，之后根据选定的GIS软件分别对飞行程序设计中的标准仪表离场障碍物鉴别面、精密进近障碍物评价面、目视航段面和类精密进近障碍物评价面的三维保护区划设进行了研究，并对标准仪表离场障碍物鉴别面、精密进近障碍物评价面、目视航段面和类精密进近障碍物评价面中障碍物自动评估软件进行了开发设计。最后利用本文开发的机场选址阶段飞行程序辅助决策系统对达州机场迁建工程飞行程序中标准仪表离场障碍物鉴别面、精密进近障碍物评价面、目视航段面进行了三维保护区实现和保护区内障碍物的自动评估，结果显示选址阶段飞行程序辅助决策系统有效的提高了机场选址阶段飞行程序的可靠性和设计的效率。