本研究为解决暗纹东方鲀养殖过程中病虫害的防治方法,从提高鱼体自身免疫出发,探讨存在哪些与哺乳类、鸟类BlyS基因相关性的DNA序列以及这些序列的性质。人B淋巴细胞刺激因子(又称为BAFF、BlyS、TALL-1、zTNF4、THANK)是1999年发现的肿瘤坏死因子超家族的成员之一,它与某些免疫疾病的致病机制密切相关,低量或过量表达均能引起机体的免疫失衡。根据四种已知高度保守的BlyS同源片段设计引物,同时以草鱼、青鱼模板做外对照,人模板做阳性对照,经PCR扩增、割胶回收、克隆测序。结果表明:以鱼基因组为模板经PCR扩增获得了542bp、349bp、221bp三条片段;以人基因组为模板获得5条片段,将最亮一条测序,发现是位于14号染色体上的片段,与人BlyS没有相关性。542bp序列在暗纹东方鲀和草鱼中是非常保守的,A含量最低占18.8%,判断此段序列属于红鳍东方鲀基因组文库中“N(任意核苷酸)”区,填补了红鳍东方鲀基因组文库(2007)数据的空白。349bp和221bp在暗纹东方鲀、红鳍东方鲀及草鱼中都是保守的。因此542bp、349bp、221bp三条片段属于引物特异性扩增,但对于BlyS来说是非特异性片段。暗纹东方鲀和红鳍东方鲀序列比对分析显示:349bp序列中,转换颠换各发生3次、1次,插入/缺失12次。221bp序列中,碱基替换各1次,插入/缺失共6次,以上结果符合大多数生物DNA序列进化中转换大于颠换的现象,但插入或缺失出现的频率要远远高于碱基转换和颠换。在暗纹东方鲀和红鳍东方鲀中碱基突变的主要方式为插入或缺失。同时用生物学软件将此三段DNA序列按照三种读码框自动翻译成氨基酸序列,能够折叠成类似BlyS蛋白空间结构的可能性很小,在蛋白质数据库中做Blast,同样没有发现与BlyS蛋白相关性序列。结论:此三条序列与BlyS蛋白的相关性很小,并且也不属于其他性质的基因或蛋白,推测可能是新发现的三段序列,有待进一步研究。