2004～2006年全面调查了广州市渔业水域水质和底质理化特性，在此基础上综合评价了水域的营养状态和环境现状，并根据渔业资源所特有的生物和经济特性，利用生态学手段，从理论和实践两方面对渔业资源可持续利用评价及其预警系统进行研究探索，为水域渔业资源的合理利用和渔业环境的生态学管理提供理论基础。主要研究结果有：广州市天然渔业水域水质的主要污染物为N、DO、BOD5、COD和石油类，而表层沉积物的主要污染指标为重金属和石油类。从时空分布上来看，广州市天然渔业水域水质主要污染指标的季节变化表现为枯水期高于丰水期的基本特征，而平面分布表现为珠江广州段＞珠江口广州段＞东江广州段＞北江广州段的基本格局；沉积物重金属指标的平面分布格局与水质相同，而季节变化却与水质调查结果相反，表现为丰水期高于枯水期的季节变化特点。天然渔业水域典型沉积物内源重金属潜在生态危害评价的结果表明：沉积物重金属潜在生态危害系数最大的是Cd，其生态危害等级为强，个别测站达到很强甚至极强水平；其次为Hg，为中等生态危害等级；而其它3种重金属Cu、Pb和As的生态危害较低，仅为轻微水平。在Cd生态危害系数的影响下，沉积物重金属潜在生态危害指数也较高，绝大多数站点的生态危害程度达到中等或强的水平。利用模糊综合数学评判法对水体环境质量的评价结果表明北江广州段和珠江口广州段南端以及东江广州段东部水域的水质状况良好，多可达到Ⅰ、Ⅱ类水质要求，而珠江广州段水体污染最为严重，多为Ⅳ、Ⅴ类水质，甚至部分江段达到劣Ⅴ类水质。对广州市渔业增养殖水域的研究调查发现，养殖水域水体的主要污染指标为总大肠菌群和石油类，特别是石油类在部分养殖基地的污染非常严重，从整体上来看养殖水体的污染程度要高于水源水。利用综合污染指数法对养殖水体环境质量综合评价结果表明，渔业增养殖区水域环境质量属于轻度到重度污染水平，但地域差距明显，部分养殖基地养殖条件落后，养殖水域污染相对较重。对水产品安全质量现状调查研究发现，广州市水产品存在重金属和渔药残留超标等问题。针对以上问题，本文详细分析了导致水产品质量安全问题的根源，并从技术、经济、政策法规等方面提出了一些建议和对策。综合以上结果，广州市渔业水域环境质量状况不容乐观，水体的主要污染物为有机污染物和营养盐类，沉积物重金属污染较严重，水体富营养化水平很高，部分渔业水域环境恶化，已经不适宜鱼类的生存与繁衍，水产养殖业和水产品的质量安全存在一定的隐患，水产品存在重金属和渔药残留超标等现象。水体交换能力较差、陆源排污捧废严重和来自养殖业的二次污染是造成这种现状的主要原因。