河南汉族人群ERCC2基因标签SNPs与食管鳞状细胞癌关系研究

来源 :郑州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chen1052333209
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目的DNA损伤修复基因是重要的肿瘤易感基因,切除修复交叉互补2组(Excision repair cross complementation group2, ERCC2)/着色性干皮病互补D组(Xeroderma pigmentosum complementation group D, XPD)是核苷酸切除修复(NER)通路的重要组分,其编码的蛋白质参与核苷酸切除修复,其基因多态性的存在可以降低个体DNA损伤修复能力,有可能增加肿瘤易感性。目前,国内外关于ERCC2基因多态性与疾病易感性的研究很多,但这些结果都不大一致,而且大多主要关注Lys751Gln位点和Asp312Asn位点等功能性的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点,无法获得整个基因的信息,缺乏对基因整体上的把握。有研究表明,有一些特殊的SNP位点可以捕捉到其他大部分多态位点的遗传信息,即选择一些SNP位点作为标签SNP,这些位点可以代表整个基因组的全部信息,无论它们是否功能位点。本研究通过分析由人类基因组计划数据库挑选出的ERCC2基因标签SNP获得全基因信息,从而探讨多态性与食管癌遗传易感性关系,以及基因-基因、基因-环境之间的交互作用在食管癌发生中的作用。方法采用病例对照研究方法,按性别和年龄进行频数匹配选择405例来自医院的原发性食管癌病例和405例来自人群的健康对照,收集其相关资料;采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测ERCC2基因3个标签SNP (rs3916874, rs238415, and rs1615836)和2个功能性位点(Asp312Asn和Lys751Gln)基因型。用统计学软件SPSS12.0对病例组和对照组样本的特征进行频率描述,χ2检验比较病例组和对照组之间吸烟、性别、年龄、饮酒、癌症家族史、各种基因型等因素分布的差异;用Haploview4.2软件分析Hardy-Weinberg平衡,LD值和单体型。用Logistic回归计算调整吸烟、性别、年龄、饮酒和癌症家族史等混杂因素后的比值比(OR)及95%可信区间(95%CI)。基因-环境交互分析采用多因子降维法(MDR)。结果在单个SNP位点中仅发现Lys751Gln位点联合突变基因型(AC+CC)能增加食管癌发病的风险(OR:1.45,95%CI:1.06-1.99,P<0.05);单体型5(rs3916874G-rs238415C-rs1618536G-Asp312Asn G-Lys751GlnC)和单体型7(rs3916874G-rs238415G-rs1618536A-Asp312Asn G-Lys751GlnC)能增加患病的风险(OR:2.16,95%CI:1.27-3.57;OR:3.72,95%CI:1.89-6.63)。单体型分析的结果进一步验证了Lys751Gln位点的C等位基因能增加食管癌的发病风险。在三个标签SNP的单体型(rs3916874-rs238415-rs1618536)分析中发现:单体型GCG和GGA能增加食管癌的发病风险,OR及95%C1分别为1.46(1.17-1.81)和1.46(1.18-1.80);单体型GCA和GGG能降低食管癌的发病风险,OR及95%CI分别为0.46(0.31-0.68)和0.30(0.21-0.44)。MDR软件分析基因与环境交互作用显示rs238415,rs1618536和家族史存在正交互作用(OR:3.23,95%CI:2.37-4.40)。结论ERCC2基因SNP位点(MAF>0.1)的单体型与食管癌的发病风险之间存在关系,Lys75Gln位点的C等位基因能增加食管癌的发病风险,而且ERCC2基因多态性和癌症家族史之间有明显的协同作用。
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