随着创新意识的不断增强,创新投入的增加,创新结构不断优化,我国创新产出的数量和质量水平在不断提高。根据世界知识产权组织公布的2017年数据显示中国的国际专利申请量超越日本,成为世界排名第二的国家,并保持两位数的增长。但是与世界发达国家仍存在明显的创新差距,同时我国还存在区域创新分布不平衡的现象。所以探讨创新产出在空间上的分布差异和影响因素具有重要意义。本文基于大量文献分析的基础上,梳理了国内外关于创新产出的空间差异以及影响因素的相关文献,基于2004-2016年的统计数据,以全国285个城市的发明专利、实用新型专利和外观设计专利为基础,根据创新含量的差异使用熵值法计算创新综合得分表征创新产出,并将我国划分为东中西及东北地区,分析我国城市创新产出的空间差异现状以及影响因素。实证结果表明:(1)较2004年我国创新产出水平有了明显提高,总体呈现由东部沿海城市和长江沿岸城市组成的“T”型,创新产出具有明显的整体性和地带性分异特征。(2)全国城市的创新产出具有明显的空间相关性,且创新产出的空间结构具有锁定效应。(3)在全国范围内,创新产出的空间外溢效应明显,科技从业人员、教育水平、工业基础、信息化程度对城市的创新产出具有明显的促进作用。固定资产投资对我国创新产出的提高具有挤压效应,同时政府政策支持对我国城市创新产出的促进作用并不明显,外商直接投资会促进周围城市创新产出的增加。工业基础和信息化程度的空间溢出直接效应、间接效应和总效应都很明显。(4)创新空间外溢效应仅存在于中部地区,各要素对四个地区创新产出的影响有所差异,每个区域在提升创新产出水平时要结合本地区具体情况并密切城市间的协同联动。最后本文在研究结论的基础上提出了针对性建议。