G-四联体的构象调控及其与小分子配体的相互作用研究

来源 :温州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jackmengxiaojing
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肿瘤是一种严重影响人类身体健康和生命的常见病以及多发病,也是治疗难度最大的、投资力度最大的疾病之一。研究表明,能够诱导富含G序列DNA形成G-四联体或稳定G-四联体结构的小分子配体,可通过抑制端粒酶活性或降低癌基因转录表达而达到抑制肿瘤的效果。本论文中,我们用得到的黄酮类化合物与G-四联体相互作用,用电化学方法来考察其相互作用方式,再通过模拟来计算其结合能的大小。所取得的主要成果,现罗列如下:1.对黄酮类化合物(芹菜素,芸香叶苷,槲皮素)加以表征,如:质谱,核磁共振(1H,13C),红外等表征手段加以确认其结构,便于更好的分析其与DNA之间的相互作用方式。2.用电化学方法,如电化学阻抗谱,循环伏安法,微分脉冲伏安法等对黄酮类化合物与G-四联体之间的相互作用进行测定。3借用AutoDock等模拟手段,对DNA和黄酮类化合物进行模拟对接,确认其连接方式(如大凹槽,小凹槽,顶端或者低端,亦或者两者兼有)。通过实验和模拟之间的相互比对,我们最终确认:芹菜素和G-四联体之间结合能大小:-8.20kcal/mol,相互作用大小为1.26×104M-1,结合模式嵌入模式。槲皮素和G-四联体之间结合能大小:-6.90kcal/mol,相互作用大小为9.42×103M-1,结合模式为沟槽绑定。芸香叶苷和G-四联体之间结合能大小:-3.17kcal/mol,相互作用大小为1.56×104M-1,结合模式沟槽绑定。
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