【摘 要】
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单核苷酸多态性数据库储存分析结果.整个系统分成三个部分,分别负责数据的传输,初步分析和通过WEB形式对结果的访问.测序数据首先将被传输到服务器,在服务器中通过我们自己设
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单核苷酸多态性数据库储存分析结果.整个系统分成三个部分,分别负责数据的传输,初步分析和通过WEB形式对结果的访问.测序数据首先将被传输到服务器,在服务器中通过我们自己设计的SNP搜寻程序对数据进行格式转换,去除载体污染,然后再进行SNP发现,单倍型分析等一系列操作,最终的结果将存进数据库.系统的最后是网页界面,通过该界面用户可以对数据库进行访问和修正,并且可以通过系统提供的一些分析工具在线对SNP数据进行进一步的分析.根据该实验的研究方向,我们开发了新的SNP搜寻程序,程序同时用两种标准判定杂合位点,以保证结果的完整、准确.为了验证该程序,我们对来自中国南方人群的65个DPB1基因第二外显子测序结果进行分析.结果显示,程序基本能够找出测序结果中存在的杂合位点.系统分析的结果将存入实验室的SNP数据库中,根据SNP所在的区域.样品所属的民族等信息分类,内部用户可以通过WEB界面对数据库进行访问和修正其中部分的SNP信息,经过整理的一些统计结果也将通过我们的网站向外界公布.
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