用RAPD技术对三类水产经济动物基因组DNA多态性的研究

来源 :大连水产学院 大连海洋大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lpwxlwan
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利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术,分别对13种双壳贝类、3种鲍——中间鲍(Haliotis midae)、皱纹盘鲍(H.discus hannai)和九孔鲍(H.diversicolor supertexte)以及5种经济类海胆——紫海胆(Anthocidaris crassispina)、海刺猬(Glyptocidaris crenularis)、马粪海胆(Hemicentrotus pulcherrimus)、光棘球海胆(Strongylocentrotus nudus)和中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)的基因组DNA多态性进行检测,对其亲缘关系进行了初步的探讨.其主要结果如下:1.经20个随机引物对3个科的13种双壳贝类(其中帘蛤科9种、蛤蜊科3种、樱蛤科1种)基因组DNA进行扩增,共得到558条扩增片段,片段长度在200~1 800bp之间,UPGMA和NJ两种聚类分析方法分别得到的系统树结果基本一致.帘蛤科、蛤蜊科和樱蛤科三科之间存在差别,蛤蜊科与帘蛤科的镜蛤亚科聚在一起,因而帘蛤科与蛤蜊科的亲缘关系较近,而与樱蛤科的亲缘关系相对较远.帘蛤科的种类基本聚为一类,与传统分类相吻合;帘蛤科各亚科间表现出不同的差异,镜蛤亚科与实验所的帘蛤科的其它亚科的亲缘关系较远,菲律宾蛤仔与青蛤、江户布目蛤与文蛤的亲缘关系较近,紫石房蛤与青蛤和文哈的亲缘关系较近,而与江户布目蛤较远.2.经24个随机引物对3种鲍基因组DNA进行扩增,共得到376条扩增片段,片段长度在250~2 500bp之间.由平均遗传距离指数,用UPGMA和NJ两种聚类分析方法得到的结果基本一致,3种鲍聚为三类,与3种鲍形态上存在明显差异的结果基本吻合.3.经20个随机引物对5种经济类海胆基因组DNA进行扩增,共得到377条扩增片段,片段长度在200~1 400bp之间.两种聚类分析方法进行处理得到的结果也一致.长海胆科与疣海胆科有较近的亲缘关系,球海胆科的光棘球海胆与中间球海胆有较近的亲缘关系,其次是马粪海胆.
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