中国人群抗原加工相关转运体(TAP)基因多态性研究及其与强直性脊椎炎(AS)疾病关联分析

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本研究第一部分工作为基于TaqMan Real time PCR技术,建立了人类抗原加工相关转运体基因TAP1和TAP2等位基因分型方法学并进行群体遗传学研究,即调查TAP1和TAP2多态性在中国汉族人群中的分布,并计算基因频率,分析TAP1-TAP2、TAP1-DRB1、TAP2-DRB1和TAP1-TAP2-DRB1等单体型分布特征,并与其他不同人群TAP基因多态性分布进行比较。第二部分工作为研究遗传同质性的中国汉族人群HLA-B27阳性强直性脊椎炎病人、HLA-B27阳性健康对照人群和HLA-B27阴性健康对照人群TAP SNP多态性和单体型,进行TAP多态性与AS疾病之间的关联分析。在第一部分群体遗传学研究中,共检测到5种TAP1等位基因(TAP1*0101、TAP1*020101、TAP1* 020102、TAP1*0301、TAP1*0401)和4种TAP2等位基因(TAP2*0101、TAP2*0102、TAP2*0103、TAP2*0201),TAP1和TAP2基因型分型结果符合Hardy—Weinberg定律(P>0.05)。其中TAP1*0101(79.79%)和TAP2*0101(82.74%)在中国汉族人群中分布最广。在双座位单体型分布中,有1条TAP1-TAP2单体型(TAP1*020101-TAP2*0102)强连锁(χ~2>10.83),3条TAP1-DRB1单体型(TAP1*020101-DRB1*03、TAP1*020102-DRB1*13和TAP1*0301-DRB1*16)强连锁(χ~2>10.83)和3条TAP2-DRB1单体型(TAP2*0102-DRB1*09和TAP2*0103-DRB1*04)强连锁(χ~2>10.83)。在三座位单体型中,有4条单体型存在显著连锁不平衡现象(D’>0.5),它们是TAP1*0101-TAP2*0101-DRB1*07、TAP1*0101-TAP2*0103-DRB1*04、TAP1*020101-TAP2*0101-DRB1*03和TAP1*020101-TAP2*0102-DRB1*13。中国人群TAP1等位基因多态性与其它人群分布差异性比较,除Guasani、Kaingang和Anotolian人群外没有统计学意义(P>0.05)。TAP2等位基因多态性与其它人群分布差异性比较,均有统计学意义(P<0.05)。基于Taq Man PCR技术的TAP1和TAP2等位基因分型技术分辨率高,简单快速,结果直观、准确。Human leukocyte antigen(HLA)-B27与慢性自身免疫性疾病强直性脊椎炎(AS)之间存在强连锁关系。而其他自身免疫性疾病关联基因如TAP亦可能影响AS的发生和发展。TAP在获得性免疫应答过程中起关键作用,其编码基因发生突变会对抗原的选择、加工与递呈产生一定影响,可能导致某些自身免疫性疾病的发生与发展。因此本研究第二部分工作是探讨TAP基因(TAP1和TAP2)SNPs多态性与B27~+AS疾病之间是否存在关联,TAP基因是否在AS的病理过程中发挥作用。共分析了B27~+AS病人、B27~-健康对照和B27~+健康对照的6个TAP1 SNPs位点和3个TAF2 SNPs位点多态性情况。等位基因和基因型分析结果显示,在病人—B27~-健康对照组里面,TAP1p1910位点基因型AG、等位基因G和TAP2 p1693位点基因型AA明显增大AS的发病风险(P<0.05)。SNP单体型分析显示,在病人-B27~-健康对照组里面,TAP1 SNP单体型(GGGGGG,TAP1*020101)和TAP1-TAP2 SNP单体型(GGGGGG-GGG,TAP1*020101-TAP2*0101;GGAAGGGAG,TAP1*0101-TAP2*0102)明显增大AS的发病风险(P<0.05)。相反,TAP1-TAP2 SNP单体型GGGGGG-GAG(TAP1*020101-TAP2*0102)在B27~-健康对照组里的频率高于病人组(P<0.05)。并且,在病人-B27~+健康对照组里面,TAP1-TAP2 SNP单体型GGGGGG-GAG(TAP1*020101-TAP2*0102)和单体型GGGAGG-GGG(TAP1*0301-TAP2*0101)在B27~+健康对照组里的频率高于病人组(P<0.05)。说明这两条单体型在AS的致病机理中具有保护倾向。这些数据表明,在AS的致病过程中,不同的TAP多态性可能影响着不同的抗原肽的选择和递呈,进而潜在影响着AS的发病与发展。
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