右美托咪定对重型创伤性脑损伤患者miRNA表达谱的影响

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Jeanneyli
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[目 的]研究重型创伤性脑损伤(severe traumatic brain injury,sTBI)患者予静脉持续微量泵泵入右美托咪定(dexmedetomidine,DEX)后患者外周静脉血miRNA的表达差异,预测这些具有差异表达的miRNA所调控的靶基因,分析其可能的生物学功能。[方 法](1)收集2020年5月至2020年12月未经手术收住在昆明医科大学第一附属医院EICU的3例sTBI患者外周静脉全血标本;(2)采用高通量测序技术进行miRNA测序;(3)筛选出患者使用DEX前后具有表达差异的miRNA;(4)使用miRanda和RNAhybrid数据库对这些具有差异表达的miRNA进行靶基因预测;(5)通过生物信息分析,运用GO和KEGG数据库分别对这些预测的靶基因进行功能分析。[结 果](1)与患者使用DEX之前相比,患者使用DEX后外周静脉血中有15个miRNA具有表达差异,其中10个miRNA(即:hsa-miR-1 5b-5p,hsa-miR-181a-5p,hsa-miR-107,hsa-miR-93-5p,hsa-miR-155-5p,hsa-miR-942-5p,hsa-miR-4685-3p,hsa-miR-454-3p,hsa-miR-15a-5p,hsa-miR-450a-5p)表达下调,5个 miRNA 表达上调(即:hsa-miR-148a-3p,hsa-miR-3158-3p,hsa-miR-3158-5p,hsa-miR-100-5p,hsa-miR-582-3p)。(2)这 15 个差异表达的 miRNA 共预测出 3864个对应的目标靶基因。(3)GO分析结果显示:目标靶基因主要富集的生物学过程包括细胞过程(cellular process)、单有机体过程(single-organism process)、单有机体细胞过程(single-organism cellular process)、代谢过程(metabolic process)、有机物质代谢过程(organic substance metabolic process)等;在细胞组分层面主要定位于:细胞(cell)、细胞成分(cell part)、细胞内(intracellular)、细胞外成分(intracellular part)、细胞器(organelle)等;主要发挥的分子功能包括:分子功能(molecular function)、结合(binding)、蛋白结合(protein binding)、催化活性(catalytic activity)、有机环状化合物结合(organic cyclic compound binding)等。(4)KEGG分析结果显示:目标靶基因主要富集于内吞作用(Endocytosis)、AMPK 信号通路(AMPK signaling pathway)、光传导(Phototransduction)、溶酶体(Lysosome)、糖胺聚糖降解(Glycosaminoglycan degradation)、轴突引导(Axon guidance)这6条通路。[结 论](1)sTBI患者予持续静脉微量泵泵注DEX后,患者外周静脉血中的miRNA表达谱存在差异。(2)sTBI患者使用DEX前后miRNA的表达差异,为TBI患者使用DEX提供了理论依据,并为后续找到DEX治疗TBI的治疗靶点打下基础。
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