中国和日本经贸关系非常紧密，日本是中国第三大贸易伙伴国、第五大出口市场和世界最大的农产品进口国之一，而中国是日本第一大出口市场，中日贸易在中国对外贸易中占有很大比例，2010年，中日贸易额就高达2978亿美元，2011年，中日贸易额增加到3428亿美元，比2010年增长15．1%，占我国对外贸易额的10%。然而在中日贸易的发展过程中，贸易摩擦随之而来，特别是农产品贸易摩擦近年来不断发生，成为阻碍中日贸易发展的重要因素，给两国经济乃至世界经济带来了严重影响，采取什么样的对策应对中日农产品贸易摩擦问题，已成为当务之急。本文从中日农产品贸易的现状出发，以赫克歇尔-俄林的资源禀赋理论为基础，概括出近年来中日农产品贸易摩擦的主要表现，即：日本利用《农业协议》保障措施对我输日农产品实施限制；农产品质量问题引发的贸易摩擦；日本修改《种苗法》和《关税定率法》，限制植物性农产品进口；日本过高的检查标准使我输日产品受阻；“肯定列表制度”引发的贸易摩擦；“毒饺事件”引发的贸易摩擦；日本采用严格的技术性贸易壁垒对我农产品进行限制。以此为依据，得出了中日农产品贸易摩擦的特点，包括：涉及农产品范围较广；检疫检查的项目繁多；容易引起“羊群效应”；容易产生巨大的关联效应。接着从国际、中国和日本三方面分析了产生农产品贸易摩擦的原因，并分析了中日农产品贸易摩擦的影响，最后分别从政府、农业行业协会和农业经济个体三个层面提出了解决中日农产品贸易摩擦的对策，包括：完善我国农产品出口管理体制；制定农产品出口新战略；改革农业行业协会管理体制；完善农业行业协会内部运行机制；应加强农产品出口企业对WTO贸易规则的了解；加大对农产品出口企业的科技投入，提高农产品质量；大力发展特色经济，促进绿色农产品出口；创建农产品自主品牌；大力发展农产品加工贸易。