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链霉菌因其拥有丰富的初级代谢途径以及无以伦比的次生代谢合成能力闻名遐迩。传统的观念认为调控蛋白构成了代谢调控系统的主体。直到近期人们才逐渐发现,代谢产物在代谢调控系统中同样具有重要的作用。本论文以链霉菌相关初级代谢和次生代谢中几个重要的调控基因为靶点,旨在阐明其调控的分子机制,为抗生素产生菌的产量提高及途径的定向改造提供依据。
hppD(编码4羟基苯丙酮酸双加氧酶)及调控基因hpdA和hpdR这三个基因在天蓝色链霉菌酪氨酸降解代谢途径中扮演着重要的角色。HpdA激活hppD同时阻遏自身编码基因的转录。而HpdR仅在酪氨酸存在下,才对hppD和hpdA行使抑制。实验证据表明,这是由于hppD的底物(四羟基苯丙酮酸)与HpdA和HpdR直接结合,从而精细地调节了两者对hppD的调控。
JadR1激活杰多霉素生物合成基因.jadJ而抑制自身编码基因的转录,然而JadR1对自身编码基因的抑制仅发生在杰多霉素大量产生之前。杰多霉素生物合成途径的后期产物(尤其是杰多霉素A,B)与JadR1直接结合从而导致JadR1从其识别的启动子上脱离,首次揭示了非典型应答调控蛋白能结合小分子配体。此外,NarL家族非典型应答调控蛋白RedZ同样可以直接结合其调控的终产物十一烷基灵菌红素,说明终产物的自调控系统可能在非典型应答调控蛋白所调控的次生代谢生物合成中广泛存在。
JadR2负调控杰多霉素生物合成基因簇中大多数合成基因的转录并可与jadR1的启动子直接结合。同源比对揭示,JadR2和假γ-丁酸内酯受体BarB同源性较高,且其高级结构与可以结合多种抗生素的多药耐药性调控蛋白十分相似,暗示JadR2的配体很可能是抗生素而不是γ-丁酸内脂。EMSA结果证实,JadR2的确可与杰多霉素生物合成途径的后期产物直接结合,这是有关假γ-丁酸内酯受体功能的首次发现,同时说明JadR2在杰多霉素自调控系统中发挥了重要的作用。