Stargardt病、视锥—视杆营养不良与Nance-Horan综合征家系的致病基因突变筛查

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背景:遗传性眼病是由于遗传物质改变所导致的眼部疾病,对眼的结构和功能危害严重,且部分眼病不易在早期发现,是当前影响视觉系统的重要疾病。该类疾病具有众多特点包括:病种多,发病率高,治疗困难,预后较差,致盲性高以及具有高度临床与表型异质性。全外显子组测序(Whole-Exome Sequencing,WES)是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。相比于传统的Sanger测序,该测序方法具有众多优点包括:高效便捷,对样品要求低、灵敏度高,获得的信息量丰富,可以检测到新的致病基因。目的:鉴定 Stargardt 病(Stargardt disease,STGD)、视锥-视杆营养不良(Cone-rod dystrophy,CORD)与 Nance-Horan 综合征(Nance-Horan syndrome,NHS)共三种遗传性眼病家系的致病基因突变,以期发现新的致病突变。同时为患病家系提供有效的遗传咨询,进一步丰富相关疾病的遗传学研究。方法:首先根据家系的初步诊断,查询并获得文献中已报道的相关疾病的致病基因。收集该家系成员的临床检查结果和血液样品,对该家系的先证者进行全外显子组测序。在测序结果中筛选相关致病基因的非同义突变作为最初的候选致病突变。然后通过一系列的生物信息学分析、Sanger测序验证以及共分离分析对这些候选突变进行层层筛选并得到该家系的致病基因突变。最后利用ACMG遗传变异分类与指南对家系的致病突变进行分类。如果在已知致病基因中未筛选得到患病家系的致病突变,则需要扩大候选基因范围或对新的基因进行研究。结果:在STGD家系中筛选得到ABCA4基因中的复合杂合突变NM000350.2:c.5646G>A:p.M1882I,c.3523-2A>G;在CORD家系中筛选得到CRX基因中的移码突变NM000554.4:c.538dupG:p.Val180fs;在NHS家系中筛选得到NHS基因中的移码突变NM001291867.1:c.302dupA:p.Ala102fs。共分离分析结果表明这三个突变均与家系中的疾病表型共分离,为家系中的致病突变。其中ABCA4中的剪接位点突变以及CRX和NHS中的移码突变均为第一次报道。结论:通过WES,在三个遗传性眼病家系中筛选出三个新的致病突变。新的致病突变的发现拓宽了相应疾病的致病突变谱,有助于为家系成员提供有效的遗传咨询。研究表明WES是一种进行遗传病家系遗传诊断的有效工具。对于一些临床症状不典型的眼病患者,疾病的确诊需要临床表现与遗传诊断的结合。
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