癌症是人类面临的复杂疾病之一。目前治疗方法主要是传统的手术治疗,其次是局部放疗、化学疗法和内分泌治疗,但是术后复发和转移仍是困扰研究者的主要问题。随着生物信息学的发展,基因治疗逐渐应用于癌症。基因治疗的预后效果依赖于癌症基因标志物的准确度,因此筛选癌症基因标志物成为当前的研究热点之一。为了筛选具有较高诊断与鉴别能力的癌症基因标志物,本文主要探讨基于基因标志物构建的癌症患者预后指数优化方法。首先,对来源于肿瘤基因组图谱数据库的癌症基因表达数据进行预处理,对癌症基因表达数据进行差异分析,选出癌症中差异表达的基因,分别对比当预后指数选取中位数、平均数和众数时的生存分析结果。然后,运用拟合函数法优化患者预后指数的选取,将差异表达的基因数据分组,进行生存分析和受试者特性曲线评估,筛选出差异性较大的基因,作为基因标志物。进而,运用基因综合表达数据库中的独立数据库,对筛选出的基因标志物进行评估,验证所筛选出基因标志物的预后结果。此外,本文以发病率较高的乳腺癌和死亡率较高的肺癌为例,运用优化的预后指数选取方法筛选出乳腺癌和肺癌的基因标志物,为乳腺癌和肺癌的治疗策略和准确预后提供一定的科学依据。