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农村医疗保障制度的滞后影响了农民生活水平的提高,制约了农村经济的发展。建立健全农村医疗保障制度,成为落实科学发展观,构建和谐社会的一项十分重要的内容。新型农村合作医疗制度已经成为农村医疗保障制度的主体内容,建立健全农村医疗保障制度的核心是建立和完善新型农村合作医疗制度,为此研究新型农村合作医疗制度有其历史和现实意义。本文通过对山东省新型农村合作医疗制度的现状描述,回顾了农村合作医疗制度的发展历程,从政府、供方、需方三方面深入分析了当前新型农村合作医疗制度在实施和贯彻执行过程中存在的问题,并利用HACCP模型针对出现的问题提出相应的对策。首先,总结了国内外有关合作医疗方面的研究成果,对与本文密切相关的社会保障与医疗保险理论以及合作医疗的相关理论进行了深入的分析。对医疗保险相关的法律法规进行了描述,并使这些理论融入到了本文的研究体系中,奠定了本课题分析问题的理论基础。其次,通过对新型农村合作医疗制度的概念和研究现状的描述,从山东省新型农村合作医疗制度的实际情况出发,介绍新型农村合作医疗制度的运行机制。再次,从山东省新型农村合作医疗制度的建设概况出发,以菏泽市为例,分析山东省新型农村合作医疗制度的实施现状。主要包括试点县的参合、筹资、补偿和参合农民受益情况;对威胁新型农村合作医疗制度的因素进行论述,主要包括制度缺陷、地区经济发展差异、政府、农户、医疗服务系统和保险系统等方面。最后,通过对HACCP模型的相关理论的运用,对HACCP模型的构成及细节进行相关的介绍,针对山东省新型农村合作医疗制度中存在的问题提出相应的对策。利用HACCP模型的五个关键控制点对新农合的建设提出针对性的建议。