长壮蝎蝽和斑衣蜡蝉线粒体基因组测序及分析(昆虫纲:半翅目)

来源 :南开大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hexin123456789
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本研究旨在获得异翅亚目和蜡蝉亚目代表类群线粒体基因组的核苷酸序列及基因排序等信息,为后续解析广义半翅目的毕业线粒体结构和分子系统发育研究提供基础科学数据。   本研究测定了长壮蝎蝽和斑衣蜡蝉线粒体基因组序列,二者均为双链环状分子,包含典型的节肢动物线粒体基因组的37个基因,分别为13个蛋白质基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因,和1个A+T丰富区。两种昆虫线粒体基因组特点如下:   1.长壮蝎蝽和斑衣蜡蝉37个线粒体基因排序和典型的节肢动物完全相同。二者基因组结构紧密,除(A+T)丰富区外,基因间所有非编码序列总长度最多只有43bp,甚至在9或12对基因之间存在着基因重叠现象。   2.长壮蝎蝽和斑衣蜡蝉线粒体基因组的两条链上存在着严重的碱基偏向,其中蜡蝉具有更加显著的AT碱基偏向。两种昆虫线粒体由H链编码的基因,碱基A含量普遍高于T含量,碱基C含量均高于G含量,由L链编码的基因四种碱基含量完全与H链相反。以此推测分布在2条链上的基因在进化中所承受的选择压力是不同。   3.两种昆虫线粒体氨基酸和密码子的使用都具有强烈的偏向性。主要表现在NNU和NNA形式的密码子相对含量(RSCU值)在每种氨基酸密码子中皆占绝对主导地位,相反NNC和NNG形式的密码子相对含量普遍偏低,说明这种密码子使用的偏向性主要是由密码子第3位点碱基的偏向性决定的。还发现在所有使用的氨基酸中疏水性氨基酸占据了一多半的比例,这和线粒体基因组编码蛋白质的功能相关。   4.长壮蝎蝽与斑衣蜡蝉线粒体13个蛋白质基因的起始密码子都使用了通用的ATN作为起始密码子。两种昆虫蛋白质编码基因开放阅读框的终止密码子多数是不完整的T-tRNA或T。   5.长壮蝎蝽与斑衣蜡蝉线粒体22个tRNA基因的反密码子和多数节肢动物一致,它们的二级结构除了tRNA-Ser(GCU)缺失了DHC茎环结构外,都可以折叠成典型的三叶草结构,其中氨基酸受体茎和反密码子茎、环结构相对保守,而DHU茎环、TψC茎环和可变环的变异较大,这是造成tRNA基因长度变化的主要原因。   6.基于最小自由能的原理,对两种昆虫线粒体rRNA的二级结构进行了预测。同时还基于两种昆虫线粒体LSU rRNA序列比对的结果,预测存在28个配对区域是它们共有的。
其他文献
当前,我国正处于快速城市化时期,许多大城市开始进入了城市化进程中的城郊化阶段,在这些大城市都不约而同地出现了城郊房地产大盘开发的现象。房地产开发商在城郊化进程中扮演着
工业革命以后,人们出于对经济发展的需要,对森林的破坏越来越严重,导致资源严重短缺,土壤退化严重,为了恢复植被或获取木材资源以及恢复土壤生态环境,提高森林或人工林生产力,促进森
目的:  本研究针对XIST的敲低建立了在HEK293T细胞中的CRISPR/Cas9基因组编辑系统,以及利用该系统揭示非编码基因miRNA-146a新的转录调控机制。  方法:  1.本研究利用CRIS
肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumonia)是医源性感染中最重要的革兰阴性条件致病菌之一。其携带的质粒和其他可移动遗传元件快速地介导了获得性耐药基因的播散,包括引起全球广
渣场是水电站建设项目水土流失最敏感的部位之一,弃渣堆积过程破环了原有岩土结构、地形和植被,且堆积坡度大,稳定性差,岩土侵蚀程度剧烈,岩土侵蚀类型多样。本研究以丽江金安桥水
嗜热酶具有高催化活性、良好热稳定性及有机溶剂抗逆性,在工业生产中有着极大应用前景。但是,嗜热酶高效表达策略的不完善导致其表达量低,极端酸碱环境也造成酶分子催化效率降低
含血红素的蛋白质在生物体内具有重要的作用,同时,血红蛋白等血红素蛋白质是生物化学研究中的重要模型蛋白。本论文作者采用紫外一可见光谱和电化学手段,研究在可见光和紫外光照
核糖开关是一类顺式作用的调控元件,大部分存在于微生物mRNA的5’端,真菌和植物中也有发现。细胞中的一些代谢物和离子能够结合到特定的核糖开关上,诱导构象发生变化进而调控下
细胞骨架是真核细胞中的蛋白质纤维网架体系,是当前细胞生物学研究中最活跃的领域之一。广义的细胞骨架包括细胞外基质、细胞膜骨架、细胞质骨架和细胞核骨架,它们在结构上相互
原生动物中大部分种类细胞是无色的,但有些原生动物因为其细胞内含有细菌、藻类和其他微生物等共生体或者因为其本身皮层和细胞质内含有色素体或色素颗粒而使细胞呈现一定的颜