两种DNA损伤修复相关FEN和FEN样核酸酶功能研究

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:airfly
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
DNA损伤修复是生命体重要的自我保护机制。当基因组产生严重损伤时,细胞可以通过DNA损伤修复系统帮助DNA恢复原来的结构。核酸酶是一类重要的修复相关蛋白,能够降解损伤DNA片段,或者参与同源重组修复中DNA损伤末端的修饰。在修复过程中,蛋白质的翻译后修饰能够调控蛋白质功能,是一类重要的表观遗传。FEN1(Flap endonuclease I,分枝性内切酶)蛋白是参与DNA修复过程中的一类结构特异性核酸内切酶,主要参与DNA复制中冈崎片段的成熟和长片段碱基切除修复(Long-patch base excision repair,LP-BER)途径中降解分枝结构的作用。在研究DNA损伤修复的模式生物耐辐射奇球菌(Deinococcus radiodurans,DR)中,DNA聚合酶I(DNA polymerase I,Pol I或PolA)的N端结构域序列与FEN1十分相似,也参与了DNA损伤修复。本文就人源和DR这两种同源蛋白的核酸酶功能进行了研究。为了研究蛋白质翻译后修饰对FEN1蛋白核酸酶功能的影响,我们利用定量蛋白质组学等技术,研究了宫颈癌细胞(HeLa)在UV辐照前后蛋白质磷酸化(Phosphorylation)、乙酰化(Acetylation)和琥珀酰化(Succinylation)修饰水平的变化情况。通过生物化学、分子生物学和细胞生物学等手段验证了DNA损伤修复关键酶FEN1的保守乙酰化位点对该蛋白功能及细胞基因组稳定性的影响。我们还验证了DR菌中DNA Pol I蛋白的N端结构域的FEN-like核酸酶功能以及其对于DNA损伤修复的影响。具体结果如下:1、新鉴定到1551个磷酸化修饰位点,其中DNA损伤修复相关蛋白的磷酸化修饰水平变化明显。乙酰化修饰蛋白和琥珀酰化修饰蛋白存在较高重叠性,尤其是三羧酸循环(Tricarboxylic acid cycle,TCA循环)重要蛋白酶的乙酰和琥珀酰化修饰水平在UV辐照后出现明显上调或下调。2、验证了K252/254位点是主要的FEN1乙酰化修饰位点,FEN1突变蛋白结合DNA底物的效率降低从而导致FEN1核酸酶活性下降,且突变细胞株在UV辐照下的细胞凋亡率明显增加。3、生化试验证明DR菌DNA聚合酶A(drPolA)的N端截短蛋白也具有核酸外切酶活性和FEN活性。N端保守的金属离子结合位点天冬氨酸119/120突变成丙氨酸后导致蛋白的核酸外切酶活性降低。drPolA全长蛋白在镁离子(Mg2+)或者锰离子(Mn2+)存在下都能行使核酸外切酶活性,但在聚合功能环境下并不表现聚合酶活性,而119/120金属离子结合位点突变蛋白和N端缺失的截短蛋白drPolA-C能在体外观察到聚合酶活性。另外我们得到N端缺失突变株DR,在UV和γ辐照下发现突变株敏感度大大增加,说明N端可能参与到重要DNA损伤修复通路中。
其他文献
城市配电网规划是配电网改造与建设的一个关键环节,必须先行,规划既要切合实际,又要适当超前,正确处理近期建设与远期发展关系的同时,还要考虑社会、经济、环境的综合效益。规划应
目的:通过教师嗓音疾病的流行病学横断面调查,探讨教师嗓音疾病特点和中医证候的关系。围绕教师嗓音疾病的主要危险人群和主要危险病种,针对他们的主要危险因素,结合中医辨证
本文分别制备了具有暴露晶面的截断四方双锥TiO2纳米棒和球形TiO2纳米材料。以钛酸四异丙酯为钛源,在含有表面活性剂十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)和双十二烷基二甲基溴化铵(DDAB)
基质金属蛋白酶是一组能够降解血管细胞外基质成分的酶类.在动脉粥样硬化斑块的特定区域过度表达,可引起斑块基质的降解,从而导致斑块破裂,引发急性冠状动脉综合征.本文就基
超级电容器因为具有功率密度高、能量密度高、循环寿命长等特点,在电动汽车、军事、电子等领域具有较大的应用前景。随着科学技术的发展,对超级电容器的要求也越来越高,如何提升电极材料的电化学性能已成为能源电池材料领域的研究热点。本文利用水热反应制备了多元过渡金属硫化物或氧硫化物,通过结构调控提高了材料的电化学性能,并探索了硫化效果对电极材料性能的影响。具体研究内容如下:(1)通过对生长在泡沫镍基底上的Mn
信号与系统课程群包括"电路理论""信号与系统""数字信号处理""自动控制原理"四门课程。本文以信号与系统课程群为对象,对课程群建设内涵、课程结构整合以及课程群的实验平台建设方案
为了获取指定海水垂直剖面的水样及对应的温盐深参数,以便于分析海水成分来探索天然气水合物,利用LABVIEW图形化编程软件开发出气密采水器的测控系统,能够实现精确采样,并通过滤
针对镁合金表面耐磨性差,采用预置粉末法对AZ31B表面进行激光合金化Al-SiC粉末实验。使用光学显微镜和扫描电子显微镜(SEM)、能谱分析仪(EDS)、摩擦磨损试验机、显微硬度计对合金
阐述了冲压级进模具的结构设计及其工作过程,通过工艺分析,采用冲孔、落料工序级进冲压;通过冲裁力、卸料力、顶件力等计算,确定模具类型。该模具性能可靠,运行平稳,能提高产
随着人口老龄化,老年腹内疝的发病趋势逐渐上升。腹内疝是指腹腔脏器离开原来位置,通过腹腔内正常或异常孔道或裂隙突人到腹腔内某一解剖间隙而形成疝囊。疝孔可以是正常的解剖