在当前国家竞争科技化、企业竞争战略化及国际化发展战略盛行的大背景下，产业技术创新战略联盟已经成为国家、企业突破技术难关、增强技术创新能力的重要途径。自2007年国家成立首批产业技术创新战略联盟以来，产业技术创新战略联盟建设已上升到国家战略层面。作为我国国家创新体系的重要载体，其在全国各地各行业不断涌现。但与国外成熟的运行机制相比，由于开展时间较短、实践经验缺乏以及其他因素等，我国产业技术创新战略联盟在运行中还存在一系列问题。基于产业技术创新战略联盟的实践背景，本文将从以下方面展开研究和创新工作：首先，本文对国内外理论研究从不同角度进行了系统的综述和整理，对比发现：国内学者对于联盟运行机制的定量模型化及微观层面研究较少，缺乏系统性和深入性；通过对理论基础的梳理和分析得出，每种理论基础从不同角度具有一定的解释力，但不够全面。其次，本文对比分析了典型国家产业技术创新战略联盟的运行实践，分别总结了其运行机制与特点，为我国产业技术创新战略联盟的良好运行提供参考和借鉴。结合文献研究和实际情况，本文引入核心能力理论，揭示了核心能力与产业技术创新战略联盟构建动机的关系，系统阐述了产业技术创新战略联盟的内涵、构建框架与运行过程，丰富和发展了产业技术创新战略联盟的理论体系，并揭示和强调了其运行中具有的博弈特性，为其运行机制的博弈分析奠定基础，这是本文的创新点之一。接着，本文运用系统的博弈论分析方法，具体依据由简到繁、由静至动的假设基础以及相关均衡改进方法和委托代理理论等，分别对运行机制中的三个重要环节，即联盟成员选择机制、运行与管理机制、利益分配机制进行定性分析和定量模拟研究，得出了相应的具指导意义的结论，如联盟主导者对于联盟运行具有重要作用，联盟核心成员宜采用产出分享合同，等等。这是本文的创新点之二。最后，针对我国目前产业技术创新战略联盟运行中出现的问题进行了具体分析，并借鉴典型国家成功经验以及博弈分析得出的结论，提出了相应的对策和建议。并对产业技术创新战略联盟的研究作了进一步展望。