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冻土是个巨大的碳库,对全球气候变化有着重要的影响。随着全球气候的不断变暖,冻土融化,冻土中的有机碳被微生物分解产生CO2、CH4等温室气体,其大量释放会再次加重温室效应,使得永冻层有从碳汇向碳源转变的趋势。因此,研究冻土微生物的生态多样性及其结构与组成,对于认识其在全球气候变暖背景下,微生物所产生的生态效应以及它们对有机碳的分解所造成的对气候变化的反馈调节都具有重要的意义。本文针对我国祁连山木里水合物钻区中的两个冻土垂直剖面进行了理化性质和古菌的群落结构和组成进行了研究。研究发现,木里天然气水合物区冻土垂直剖面的土壤甲烷含量融冻层的表层（4μl/L）到永冻层较深的底层（5300μl/L）逐渐升高。土壤总有机碳含量（TOC）在垂直剖面中变化范围为2.78%18.2%。研究区古菌主要是由广古菌和泉古菌组成。广古菌包含Methanomicrobiales、Methanosarcinales、Methanosaetaceae、Methanobacteriales、Rice cluster V和热源体纲Thermoplasmata;泉古菌包含Group 1.3b/MCG-A、Group 1.1b以及热变形目Thermoproteales。其中冻土融冻层土壤中以泉古菌为优势类群（DP-14:63%86%,DTP-15:56%）;在永冻层土壤中以广古菌为优势类群（DP-14:81%86%,DTP-15:62%）。剖面土壤古菌种群的垂直分布表现为融冻层以Group1.3b/MCG-A占主导地位（DP-14:55%71%,DHP-15:56%）,永冻层Methanomicrobiales增加并逐渐占优势（DP-14:56%78%,DHP-15:37%）。研究结果显示出了剖面冻土土壤古菌微生物种类组成存在较丰富的多样性,且剖面土壤融冻层与永冻层之间在古菌群落组成上具有较大的差异性。另外,采用两对不同的高通量测序引物对古菌的组成进行对比,结果发现,采用引物Arch340F/Arch806R所检测到的古菌类群多样性高于另一对引物Arch751F/Arch1024R;两对引物对于检测到的古菌组成上也存在一定差异,采用引物Arch751F/Arch1024R更易检测到永冻层中的另一个重要类群Methanosarcinales。通过对传统16S rRNA基因克隆文库法和高通量测序两种方法对古菌的组成之间对比,采用高通量测序法往往获得较高的古菌多样性。