硒蛋白生物信息二级数据库的构建

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硒蛋白生物信息二级数据库是第一个以硒蛋白为主的生物信息数据库.构建目的是收集硒蛋白及其基因的序列数据,方便硒蛋白的核酸序列数据和蛋白质序列数据的共享,为公众提供服务,同时为下一步的研究打下基础.在硒蛋白生物信息二级数据库的整个构建过程中,使用了面向对象技术进行分析与设计.并结合软件工程中的理论,注重对软件架构和设计模式的考虑.数据库系统使用核酸序列和蛋白质序列两个数据库来分别管理核酸和蛋白质序列数据.使用JSP/JavaBeans技术开发数据库应用程序.其中,数据录入程序采用C/S架构,负责将EMBL和Swiss-Prot格式的文件导入到数据库中.数据访问部分采取B/S架构,使用JSP Model 2模式,提供WWW服务.在程序设计过程中通过分离表示和业务,有效地降低了程序的耦合性,保证了程序的可维护性.讨论并分析了在构建生物信息二级数据库中可能会遇到的一些具有共性的问题:数据地自动获取是第一个问题,该文给出了初步的设计思路:EJB是在企业级应用程序中常用地一项技术,文中详细的讨论了二级数据库中使用这项技术的利弊.
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