玉米是全世界最重要的粮食作物之一,是中国第一大粮食作物。基因芯片技术能够高通量的检测基因表达,是研究基因功能、发现新基因、疾病的治疗和发育阶段基因表达有力的工具,在玉米基因表达研究中有着广泛的应用。实时荧光定量（qRT-PCR）技术具有高灵敏性,高特异性,重复性好等特点使其应用白趋广泛。通过该技术能够快速、高效的对基因表达进行定量。内参基因是一类在不同实验条件下,各组织和细胞中能相对稳定表达的基因。通过在实时荧光定量中加入内参基因,能够去除不同样本在RNA品质、反转录效率上所存在的差异以及人为因素对定量结果的影响,校正目的基因的表达。目前还没有一种理想的内参基因,能够不因实验条件的变化而始终恒定的表达。在玉米基因表达研究中,使用的内参基因是传统内参基因,但随着近年来的研究发现这些传统内参均存在缺陷,在不同类型的细胞、组织等实验条件下,它们的表达通常变异较大。本研究通过从基因芯片数据库中挖掘玉米的新内参基因,能为不同条件下研究玉米基因表达,筛选出能提高玉米产量、品质、稳定性和抗性的基因有着重要的意义。本研究通过从公开数据库中收集基因芯片数据,筛选得到玉米新的内参基因。使用实时荧光定量进行检测,通过内参基因稳定性评估软件geNorm和NormFiner对候选内参基因稳定性进行评价,筛选出最稳定表达的内参基因和合适的数目。本研究结果如下：1.本研究通过对玉米不同生理过程基因芯片数据的分析,挖掘出143个玉米候选内参基因,为玉米mRNA水平研究提供了大量可选择的候选内参基因。这些候选内参需要通过实验验证,进一步证实其稳定性,为今后不同玉米mRNA领域提供参考。2.优化了qRT-PCR引物设计的流程。该流程使用NCBI Primer-Blast和Primer3Plus设计引物,引物通过NCBI Blast比对检验引物的特异性,并在Maizesequence数据库中Blast匕对获得唯一电子产物,并通过PrimerRankTool对引物进行评价。该流程规范化程度高,选出的引物特异性强,极大的提高了引物设计的成功率,加快实验的进度,节省了成本。3.本研究在玉米作物首次利用基因芯片成功筛选出了新的内参基因。14个候选内参基因过qRT-PCR验证,这些选候选内参基因能够在低温、干旱等胁迫条件下稳定表达。通过内参基因稳定性评估软件geNorm和NormFinder分析,得到NM₀01112080, NM₀01112147, NM₀01137886和NM₀01156648在低温、干旱等胁迫条件下能稳定表达表达,在这些实验条件下应选用4个内参基因校正数据。