稻瘟病菌无毒基因AvrPi11的定位与克隆

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由稻瘟病菌Magnaporthe oryzae(无性世代:Pyricularia oryzae Cavara)引起的稻瘟病是一种世界性的水稻病害。目前,控制该病害最经济、环保且有效的措施是培育和利用抗病品种。然而,由于稻瘟病菌的高度变异性,抗病品种的抗性往往在短时间内被克服。根据“基因对基因”学说,寄主的抗病基因与稻瘟病菌的无毒基因之间存在特异性互作而导致寄主表现为抗性反应。因此,对稻瘟病菌无毒基因的研究有助于理解抗性反应发生的分子机理,对控制稻瘟病的危害具有重要的意义。本研究旨在开展一个新稻瘟病菌无毒基因AvrPi11的定位及克隆工作,主要进行了以下几个方面的工作,结果如下:1、AvrPi11的遗传分析及初步定位为了发掘和鉴定新的稻瘟病菌无毒基因,选择携带稻瘟病抗病基因Pi11的水稻品种IRBL11-Zh,对2个田间菌株CHL42和CHL357及其有性杂交产生的219个子囊孢子菌株进行致病性分析。结果表明,致病性与非致病性菌株的比例为1:1,由此判断无毒亲本CHL42中携带一个无毒基因AvrPi11。因此,利用混合群体分离分析法(bulked segregant assay,BSA)对本实验室在稻瘟病菌70-15参考序列上开发的121个SSR标记进行筛选,得到5个位于6号染色体的连锁候选标记;进一步利用作图群体进行连锁分析,从而快速把AvrPi11定位于6号染色体的TEL12附近。2、AvrPi11的精细定位及物理图谱的构建为了对AvrPi11进行精细定位,利用70-15的参考序列开发新的标记并进行连锁分析,最后将AvrPi11定位于标记LSM6-8与CAG11-14之间约50 kb的区域。进一步将与目的基因紧密连锁的分子标记锚定到参考序列上,构建了AvrPi11的物理图谱。3、AvrPi11候选基因的预测及序列分析利用基因预测软件对参考菌株70-15、KJ201以及2个亲本菌株进行候选基因预测。结果表明,在目标区域内共有15个候选基因。随后对候选基因进行序列分析,结果确定11A4、11A5、AvrPib、11A10和11A11为最有可能的候选基因。
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