训练过程中的生物监控是运动训练中评估运动员的生理机能状况，制定合理训练方法和运动强度，有效提高运动员竞技能力的一项重要手段。但如何科学进行生物监控是国内外迄今为止尚未解决的一个难题。通过在湖北省优势项目运动队科学训练条件普遍调查的基础上，结合湖北省优势项目运动队科学训练对运动员机能评定的需求，建立运动员生物监控平台管理系统。通过开发独立软件，将项目系统训练计划结合长期测定的运动员形态、生理、生化等数据和内容输入管理系统，在开发软件运行下对每一位运动员的生理机能、专项运动能力、疲劳指数等定期进行综合分析和评定，根据不同项目训练状态下所测得的指标进行最优机能敏感性指标分析，找出几项专项针对性较强的生理和生化指标建立机能及专项运动能力评估模式。本文通过生物监控系统在水上运动队的使用，讨论了生物监控系统的科学性，为科学训练提供了理论支持，也为今后的运动训练的科技发展指引了方向。