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蛋白质与糖的相互作用是许多重要的生物过程的基础,如细胞粘附、细胞迁移和信号传导等,这些生物过程负责调控细胞和生物机体的生理功能。不仅如此,这些作用还与疾病的发生密切相关,如肿瘤细胞表面会发生异常的糖基化反应,细胞黏附是寄生虫、真菌、细菌以及病毒入侵宿主细胞的前提。因此,深入了解蛋白质与糖的相互作用的机制以及寻找能够抑制它们之间的相互作用的化合物(如抗体和小分子配体)对了解生命过程和治疗疾病至关重要。糖芯片在糖组学研究、药物开发和临床诊断等方面有着重要的应用前景,因此备受关注。为此,本论文选定糖芯片为研究对象,系统地研究了糖芯片的制备及其在蛋白质与糖的相互作用研究中的应用。主要工作包括:
1.概述了糖芯片的研究进展;
2.概述了蛋白质与糖相互作用的研究进展;
3.建立了一种新的非共价类型的糖芯片的制备方法,并研究了其在蛋白质与糖的相互作用中的应用。合成了三苯甲基糖衍生物,以96孔聚苯乙烯微孔板为固相载体,将合成的三苯甲基糖衍生物作为探针通过非共价作用(疏水作用为主)固定到96孔板表面,采用荧光标记的凝集素与探针杂交,研究制备的糖芯片在蛋白质与糖的相互作用研究中的应用,并且优化了凝集素与糖芯片的杂交条件。结果表明,三苯甲基糖衍生物能够稳定地结合在微孔板表面而不被洗脱,凝集素能够识别被固定的糖类化合物,证明制备的糖芯片能用于蛋白质对糖的识别作用的研究;通过研究小分子糖化合物的抑制作用,表明糖芯片可以用于蛋白质与糖的相互作用的抑制剂的筛选。
4.建立了一种新的共价类型的糖芯片的制备方法,并研究了其在蛋白质与糖的相互作用中的应用。以96孔聚苯乙烯微孔板为固相载体,在其表面铺上一层凝胶,将凝胶活化,优化固相化学反应条件,通过共价键将未经过化学修饰的单糖和二糖固定到96孔板表面,加入荧光标记的凝集素进行杂交,研究此类的糖芯片在蛋白质与糖的相互作用研究中的应用。结果表明,凝集素能够识别被固定的单糖和二糖,证明制备的糖芯片能用于蛋白质对糖的识别作用的研究;通过研究小分子糖化合物的抑制作用,表明糖芯片可以用于蛋白质与糖的相互作用的抑制剂的筛选。
5.通过计算机模拟蛋白质与糖的对接(docking),计算糖芯片上固定的探针与凝集素的结合自由能,从理论上验证实验数据的可靠性。