儿童紫癜性肾炎热毒伤络证lncRNA差异表达谱分析及潜在诊断标志物研究

来源 :辽宁中医药大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:Raistlin_M
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目的:1.建立紫癜性肾炎热毒伤络证患儿血清lncRNA表达谱,筛选与健康儿童相比差异性表达的lncRNA;2.分析差异表达的lncRNA靶基因富集功能及其所调控的信号通路,探讨儿童紫癜性肾炎热毒伤络证在lncRNA水平上的发病机制;3.探寻血清差异性表达lncRNA作为儿童紫癜性肾炎热毒伤络证潜在诊断标志物的可行性和临床应用价值。材料与方法:本研究采取病例对照三阶段设计,第一阶段是初筛阶段,收集紫癜性肾炎热毒伤络证患儿和健康儿童共10例样本,利用高通量测序技术检测血液中lncRNA表达谱,筛选差异表达的lncRNA,筛选标准为表达倍数变化FC≥1.5,P<0.05;第二阶段是独立验证阶段,分别收集紫癜性肾炎热毒伤络证患儿30例(设置三个分组:孤立性血尿组;孤立性蛋白尿、血尿和蛋白尿组;中度蛋白尿组),健康对照组儿童20例,通过RT-qPCR技术,对初筛阶段筛选出的候选lncRNA进行验证;第三阶段采用Pearson相关系数分析和ROC曲线分析,评价单个或者多个差异表达lncRNA作为儿童紫癜性肾炎热毒伤络证临床潜在诊断标志物的诊疗价值。结果:1.使用高通量测序技术首次获得了紫癜性肾炎热毒伤络证患儿血清lncRNA表达谱,与健康儿童相比,从紫癜性肾炎热毒伤络证患儿血液中筛选出820个差异性表达的lncRNA,其中上调的差异性表达lncRNA有34个,下调的差异表达lncRNA有786个;2.运用生物信息学技术对差异性表达的lncRNA进行分析,发现其参与体内蛋白质的产生,参与调节Fas信号通路、p53信号通路、NF-κB信号通路、B细胞受体信号通路和T细胞受体信号通路;3.对表达倍数变化FC值最显著的5个lncRNA:ENSG00000202354、ENSG00000252310、ENSG00000259001、HLA-B和ENSG00000257621在扩大样本中的RT-qPCR验证结果与测序结果一致,具有统计学意义,说明高通量测序结果较为准确;4.Pearson相关系数分析结果显示:3个lncRNA与紫癜性肾炎热毒伤络证患儿临床分级呈正相关性:ENSG00000252310(r=0.186,P<0.001),HLA-B(r=0.63,P<0.001),ENSG00000257621(r=0.42,P<0.001);另外2个lncRNA与紫癜性肾炎热毒伤络证患儿临床分级呈负相关性:ENSG00000202354(r=-0.27,P<0.001),ENSG00000259001(r=-0.04,P<0.001)。5个lncRNA的r值范围均在(-1,1)之间,P值均具有统计学意义;5.ROC曲线分析结果显示:5个lncRNA(ENSG00000202354、ENSG00000252310、ENSG00000259001、HLA-B和ENSG00000257621)的AUC范围在75.5%-88.6%之间,均具有统计学意义(P<0.001)。独立应用ENSG00000259001作为诊断标志物的诊断效率:其AUC为0.886,诊断指数为0.700,敏感性为1.000(0.832-1.000),特异性为0.700(0.506-0.853),阳性预测率为0.690(0.492-0.847),阴性诊断率为1.000(0.839-1.000),阳性似然比为3.330(2.600-4.200),阴性似然比为0;独立应用HLA-B作为诊断标志物的诊断效率:其AUC为0.853,诊断指数为0.650,敏感性为0.750(0.509-0.913),特异性为0.900(0.735-0.979),阳性诊断率为0.833(0.586-0.964),阴性诊断率为0.844(0.672-0.947),阳性似然比为7.500(5.700-9.900),阴性似然比为0.280(0.070-1.000);6.联合应用ENSG00000259001和HLA-B进行诊断效率检测发现,两者联合后的AUC增加到0.883(0.761-0.957),诊断敏感性及特异性分别为0.75和0.97。结论:1.与健康儿童相比,紫癜性肾炎热毒伤络证患儿体内的血清lncRNA的表达存在显著差异;2.差异性表达的lncRNA可能通过调控Fas、p53、NF-κB、B细胞受体和T细胞受体等信号通路,在儿童紫癜性肾炎热毒伤络证的发病中发挥重要的作用;3.Pearson相关系数分析结果显示HLA-B的诊断效率最高,提示其可作为判断儿童紫癜性肾炎热毒伤络证病情严重程度的临床标志物,即HLA-B在血液中表达量越大,紫癜性肾炎热毒伤络证患儿的病情越严重;4.Pearson相关系数分析结果显示,ENSG00000257621可作为判断儿童紫癜性肾炎病情严重程度的次要参考标志物,ENSG00000252310和ENSG00000259001不适合作为判断儿童紫癜性肾炎病情严重程度的临床标志物;5.ROC曲线分析结果显示,HLA-B和ENSG00000259001具有较高的诊断效率,联合使用HLA-B和ENSG00000259001,可提升诊断的敏感性和特异性,提示HLA-B联合ENSG00000259001可作为儿童紫癜性肾炎热毒伤络证潜在的诊断标志物;6.ROC曲线分析结果显示,ENSG00000202354、ENSG00000252310和ENSG00000257621可作为诊断儿童紫癜性肾炎热毒伤络证的次要参考标志物。
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