“三穴五针法”针刺治疗哮喘患者miRNA调控的生物信息学研究

来源 :上海中医药大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liuyi_wenzhou
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:分析“三穴五针法”针刺治疗哮喘患者全血miRNA与基因组m RNA表达谱变化,整合分析miRNA及其靶基因在针刺抗哮喘过程中的作用,筛选针刺抗哮喘发挥核心调控作用的miRNA及其特异性靶基因,从miRNA角度探讨针刺抗哮喘的作用机制。方法:根据哮喘控制测试评分(Asthma Control Test,ACT)、患者用药情况选择10例“三穴五针法”针刺治疗效果显著的哮喘患者外周血用于研究,提取外周血中的总RNA,分别用Agilent Human miRNA v21.0芯片和SBC Human((4×180K))ce RNA芯片检测患者针刺治疗前后miRNA和m RNA的表达谱,利用mi RWalk对筛选出的差异miRNA进行靶基因预测,与m RNA表达谱芯片联合分析,获得差异miRNA的特异性靶基因。利用Gene Ontology和KEGG数据库对差异miRNA的靶基因进行GO功能和KEGG信号通路富集分析。构建针刺抗哮喘的miRNA-m RNA调控网络,定位针刺抗哮喘中起核心调控作用的关键miRNA。基于关键miRNA构建miRNA-Gene-GO调控网络,筛选出针刺抗哮喘效应的关键调控靶基因,分析其在“三穴五针法”针刺抗哮喘过程中的作用。结果:1.依据差异表达显著性标准,筛选出“三穴五针法”针刺治疗哮喘患者在治疗前后共有22个显著差异表达miRNA和1381个显著差异表达的m RNA;2.miRNA靶基因预测结果显示,受miRNA调控的上调靶基因3101个,下调靶基因3869个,基于预测靶基因的生物信息学分析显示,上调靶基因主要参与代谢和刺激反应,以及体液免疫等生物过程,参与的显著性信号通路包括代谢通路、MAPK、P53、Fox O等信号通路;下调靶基因主要参与免疫反应、调节代谢过程和刺激反应等生物过程,参与的显著性信号通路包括Wnt、PI3K-Akt、T细胞受体、TNF-α等免疫、炎症信号通路,这些基因参与的生物学过程和信号转导通路在哮喘疾病中均扮演重要角色;3.miRNA芯片与m RNA芯片的联合分析显示,针刺后miRNA调控的上调特异性靶基因56个,下调特异性靶基因136个。这些特异性靶基因显著性功能主要是锌离子跨膜转运、类固醇激素的反应、磷酸蛋白磷酸酶活性调节、钙离子信号传导调节等。参与的显著性信号通路包括自然杀伤细胞介导的细胞毒性、TRP通道的炎症介质调节、磷脂酰肌醇信号系统、PI3K-Akt信号通路、p53信号通路、肌醇磷酸代谢等;4.基于miRNA-m RNA调控网络分析提示,mi R-6085、mi R-374a-5p、mi R-7975、mi R-30e-3p、mi R-6749-5p、mi R-30c-5p为针刺抗哮喘效应中发挥核心调控作用的关键miRNA;5.基于针刺抗哮喘关键miRNA构建的miRNA-Gene-GO调控网络显示,WNT10B、UBE3A、NR2F2、CCND1、PGR、CALM1、VDR、HTT、ANXA1和CLU等是针刺主要调控的靶基因。上皮细胞增殖调节、锌离子跨膜转运、ATP酶活性调节、T细胞分化调节、蛋白泛素化调节、第二信使介导的信号传导、钙离子信号传导调节、磷酸蛋白磷酸酶活性调节、对类固醇激素的反应等是针刺抗哮喘效应主要调节的生物学过程。结论:1.miRNA芯片数据分析筛选出针刺抗哮喘效应相关的22个差异表达miRNA,联合m RNA芯片分析确定192个特异性靶基因;2.对miRNA及其特异性靶基因的生物信息学分析提示mi R-6085、mi R-374a-5p、mi R-7975、mi R-30e-3p、mi R-6749-5p、mi R-30c-5p等6个miRNA在针刺抗哮喘效应中发挥核心调控作用;3.通过构建miRNA-Gene-GO调控网络显示WNT10B、UBE3A、NR2F2、CCND1、PGR、CALM1、VDR、HTT、ANXA1和CLU等是针刺抗哮喘主要调控的靶基因;4.针刺可能通过上皮细胞增殖调节、锌离子跨膜转运、ATP酶活性调节、T细胞分化调节、蛋白泛素化调节、第二信使介导的信号传导、钙离子信号传导调节、磷酸蛋白磷酸酶活性调节、对类固醇激素的反应等生物调节机制发挥抗哮喘作用。
其他文献
我国目前在学术研究层面已经对董事信义义务有较多的研究,并且立法上也有对相关概念的涉及,但是从实践上来看我国董事违反信义义务的现象仍层出不穷,并且司法上缺乏可执行的审查标准,关于信义义务的法律制度仍未完全建立起来。反收购作为一种特殊的公司活动,对于董事履行信义义务提出了新的挑战。由于董事采取的反收购措施的种类和力度可能直接影响到公司控制权的变化,进而影响到包括董事自身在内的多方主体的利益,甚至影响整
政府采购既是具有巨大消费潜能的市场,又是政府进行宏观调控管理市场的市场工具,是现代国家治理体系的重要内容。政府采购内在涉及大量财政资金管理和社会公共利益实现,因此要求其在良好的运行机制下开展政府采购活动实现供给效率是社会治理的重要内容。对采购周期中政府采购主体的限制竞争行为进行规制和采购运行机制完善,是对建立国内统一市场和充分发挥市场在资源配置中起决定作用的应有回应。市场主体的竞争是在价格持续变化
日本鲐(Scomber japonicus)是一种暖水性中上层鱼类,具有洄游特性,广泛分布于太平洋、印度洋、大西洋热带、亚热带及沿岸海域,中国、日本、韩国、朝鲜等国的近海海域均有分布。东、黄海日本鲐是中国、日本、韩国灯光围网渔业的重要捕捞对象。近年来,日本鲐渔获个体小型化现象加剧,渔获物组成偏低龄化,产量波动明显,这意味着日本鲐的资源可能已面临过度开发,因此为确保日本鲐资源的可持续利用,需对日本鲐
目的:对SD大鼠坐骨神经钳夹伤模型进行量化研究,确定不同压力对坐骨神经造成的损伤程度,建立符合Sunderland V度分类法中III度坐骨神经度损伤模型。基于坐骨神经III度损伤模型,研究大鼠坐骨神经钳夹伤后不同频率振法刺激对坐骨神经损伤后骨骼肌萎缩的影响,功能恢复与行为学之间的关系,相关神经生长因子变化规律及肌卫星细胞的作用。方法:对JZ06Cr 14厘米止血钳进行压力测定,采用JZ06Cr
摩擦摆支座是一种可以通过摩擦滑移消耗地震能量的隔震装置,由于其特有的圆弧滑动面,可以有效地限制隔震支座的位移,并在震后能够自动恢复到原位。近年来,随着隔震技术的不断发展,摩擦摆支座已逐步应用于国内外的隔震结构工程中。本文基于摩擦摆基础隔震结构的非线性振动微分方程,应用数值分析方法对结构的动力学响应进行了分析。应用响应面法,对摩擦摆基础隔震结构进行了优化分析。本文研究的主要内容如下:从摩擦摆隔震支座
据2018年交通运输行业发展统计公报分析,公路行业即将迎来又一次重大变革,进入大规模养护周期。路面裂缝检测是公路养护处理的依据,本文针对路面裂缝检测的若干问题进行了理论和实验研究,将无人机航拍技术应用于路面裂缝检测。将路面状况视频图像进行时序分帧抽样获得待识别图像,图像处理的主要目的是裂缝检测,详细来说,其过程主要包括图像降噪和分割、裂缝检测和拼接、特征参数提取和分类等。本文提出的改进算法提高了路
饮用水的安全直接关系到人类的身体健康、社会的稳定和经济的发展。亚硝胺类物质(NAs)作为新型的含氮消毒副产物(N-DBPs),由于具有强致癌性而引起人们的广泛关注。亚硝基吡咯烷(NPYR)作为典型的NAs,对其展开控制去除的技术研究具有十分重要的意义。本试验选用高效液相色谱(HPLC)对亚硝基吡咯烷(NPYR)进行检测分析。分别采用二氧化钛改性活性炭(TiO_2-AC)吸附技术、臭氧/紫外(UV-
目的:探讨反流性食管炎中医证型与幽门螺旋杆菌感染、胃镜下表现的相关性。方法:本研究以反流性食管炎患者为研究对象,病例来源于2019年2月-2020年1月湖南中医药大学第一附属医院消化内科门诊及消化内科的新入院患者,共收集到有效病例191例,收集其一般信息、中医证候、舌脉、Hp感染及胃镜检查结果,并对资料进行统计分析。结果:在本次研究统计191例反流性食管患者中,男女之比为1.27:1,发病年龄多在
本论文以非霍奇金淋巴瘤(NHL)中最常见的亚型弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)为研究对象,基于DLBCL患者血浆蛋白质组数据进行DLBCL疾病发生发展相关生物学过程、信号通路的分析,并进一步研究血浆补体水平与R-CHOP治疗DLBCL临床病理特征和预后的关系,为临床预后预测提供新的思路。基于抗体芯片技术和数据非依赖采集质谱(DIA-MS)技术构建深度血浆蛋白质组检测平台,筛选79例健康对照和147
表见代理在我国司法实践被滥用,主要原因是我国法律关于表见代理的规定不完善。我国表见代理的法律规定主要有《中华人民共和国民法总则》(以下简称“《民法总则》”)和《中华人民共和国合同法》(以下简称“《合同法》”),《民法总则》第172条延续《合同法》对于表见代理的相关规定,《民法总则》第172条实质上是表见代理的完整法条。在构成要件上,从“相对人有理由相信”导出可归责性,在法效果上,172条也规定了表