我国当前面临产业升级的主要问题就是如何激励企业大力发展自主创新。企业想要在激烈的社会竞争中生存下来,就要坚持技术创新,应该如何制定合理且具有激励高管加大研发投入力度的薪酬契约。我国于2009年设立创业板,其上市公司高新技术企业占比95%,战略创新型企业占74%,是我国经济转型阶段技术创新的主体,完全套用或者说照搬照抄薪酬制度并不一定是最契合的。结合创业板特征,研究提升创业板上市公司进行自主创新的积极性与主动性,加强研发项目风险管理,加快生成创新成果的合理薪酬结构、激励机制,为实现创业板上市公司更快更稳的走向成熟,我国经济顺利转型具有一定参考价值。探讨高管薪酬与研发投入关系的文章较少,学界还没有形成较为统一的结论,尤其是针对创业板公司,以往研究研发投入绝大部分是探讨研究阶段支出和开发阶段支出之和也就是研发费用整体,本文不但对研发支出也针对于开发支出与高管激励的相关性进行了分析,因为开发支出更能体现企业研发的积极性以及创新成果。文章采用加权最小二乘回归来控制异方差对结论的影响。文章结论为,创业板上市公司高管持股比例与企业研发投入强度以及创新投资强度显著正相关,高管短期薪酬与企业研发投入强度显著正相关与创新投资强度不显著负相关。采用薪酬激励可能促使高管多进行研发投入,不论是短期货币薪酬还是股权激励,所以认为创业板可能存在激励不足的问题,结合分组回归结论,认为创业板公司可以适当加大高管持股比例和稳定高管短期薪酬,促进高管进行有利于增加公司价值的研发活动以及充分考虑研发成果的转化问题。