农业面源污染是影响中国农村生态环境，制约乡村振兴的现实难题。在农业面源污染治理过程中，治理主体力量分散、治理工具单一、治理手段分裂、治理机制碎片化，无法形成农业面源污染的协调性、整体性治理，是现阶段农业面源治理面临的主要问题。在此背景下，如何突破现有农业面源污染过程中的碎片化治理困境，协调多元治理主体，整合各种治理手段，构建农业面源污染整体性治理机制，成为本研究的核心问题。然而，现有的研究多集中于农业面源污染的特点、成因、影响因素、技术手段防控和理论基础等方面，忽视对农业面源污染整体协同机制的系统研究。因此，本文从整体性治理视角，以世界银行贷款农业面源污染治理项目的第一批试点M市为例，从治理主体、治理手段和治理工具等方面对农业面源污染防治机制进行系统研究。
　　本研究主要运用个案分析法、规范分析法、比较分析法等研究方法，以M市世界银行贷款农业面源污染治理的具体实例为分析依据，在总结其农业面源污染治理成效的基础上，重点分析了M市农业面源污染治理面临的主要困境，包括治理主体利益协调机制不完善、政策工具协同性不足、信任体系不完善等。认为这些困境的主要成因在于农业面源污染治理主体、治理手段、政策工具、互动信任机制等的“碎片化”。为此，农业面源污染防治应以整体性治理为方向，对农业面源污染治理主体、治理手段、政策工具、互动信任机制等进行协调和整合，构建由利益协同机制、治理手段整合机制、互动信任机制和政策工具协同机制等构成的农业面源污染防治机制。