我国城镇化和工业化的快速发展，伴随着大量耕地被工业用地所占用，给耕地保护带来巨大压力。虽然我国出台了大量有关保护耕地的政策措施，但工业用地占用耕地的现象仍然大量存在。从资源价值的角度，对工业用地占用耕地进行价值损益分析，有利于发现当前我国耕地保护制度中存在的一些不足，对完善我国耕地保护的相关政策措施具有重要的理论和实践意义。本研究以福建省永泰县为例，通过构建资源价值评价体系，运用市场替代法等相关理论与方法，对工业用地及耕地资源的经济价值、社会价值和生态价值进行综合评价，并进行资源价值损益分析。研究结果表明：（1）永泰县耕地单位面积总价值为5.66万元/亩年，其中，经济价值为0.05万元/亩年，占耕地单位面积总价值的0.88%；生态价值和社会价值分别为1.66万元/亩年和3.95万元/亩年，占耕地单位面积总价值的29.33%和69.79%。耕地具有经济价值、社会价值和生态价值，但是目前我国耕地保护工作比较注重对耕地经济价值和部分社会价值的保护，而忽视耕地生态价值。尤其在土地征收补偿过程出现的问题，这显然是违背价值规律的，这种价值分配机制的不合理不仅损害农民的权益，也对我国耕地保护工作产生不利影响。（2）永泰县工业用地单位面积综合价值为9.29万元/亩年，其中，经济价值为9.23万元/亩年；生态价值和社会价值分别为-1.27万元/亩年和1.33万元/亩年。工业可以带来十分可观的经济价值，这是当前我国工业用地大量占用耕地的主要原因。但是，目前一些地方政府盲目招商引资，重复建设严重，一边大量占用耕地，另一边可能造成土地资源的闲置浪费，土地利用率较低，对生态环境也造成了一定的破坏，如果放任生态环境日益恶化，这种以牺牲环境资源为代价的发展是不可持续。（3）永泰县单位工业用地占用耕地的经济损益价值9.18万元/亩是耕地单位经济价值0.05万元/亩的183倍，但从综合价值来看，工业用地价值综合损益价值为3.63万元/亩，而耕地综合价值为5.66万元/亩，这充分说明工业用地占用耕地所产生的价值是比耕地价值更低的。在经济利益的比较下，人们总是偏好现有经济价值较高的土地利用方式，这就使经济效益低下的耕地很自然地向效益较高的其他用地（工业用地）流转，导致大量耕地的流失。为此，必须完善土地征收管理制度，建立有效的市场化运作手段，通过对耕地价值的正确评价，保障农民的合法权益，促进经济社会和生态环境的良性发展。根据评价结果，定量分析工业用地占用耕地的价值损益，为有效实施耕地资源补偿机制，保证农民权益；向耕地占用者征收生态环境补偿费；利用低丘缓坡地发展工业；科学核算绿色GDP等政策措施提供技术支持，为工业用地的良性发展和耕地资源合理利用提出对策，为完善我国土地管理提供理论依据。