放眼全球，当今社会经济日益发展，公众的权利意识日益加强。公众对政府信息披露的完整性和准确性的呼声高涨，客观上推动了全球政府会计改革的发展。按照理论先行的原则，我们应该在政府会计改革之前，先解决政府会计主体的界定问题。但是，已有研究表明，我国关于政府会计主体方面的理论研究远远滞后于实践需要。结合政府会计目标和政府会计的路径选择来探讨和分析我国政府会计主体的具体设置问题，不仅满足政府会计改革的迫切需要，也是事关我国经济社会的可持续发展的重大课题。本文首先从政府会计主体在一系列包括部门预算、政府收支分类、国库集中支付、收支两条线、政府采购等公共财政改革措施中暴露出的问题着手进行分析，认识到政府会计主体理论的滞后性，特别是政府会计主体界定的模糊性。同时，认识到新会计核算基础（权责发生制）的推行也呼唤政府会计主体的正确界定。接着深入分析原因，认识到其根源在于政府会计目标的转变和政府会计系统的缺陷。因此，本文试图重新界定政府会计主体，以解脱政府的公共受托责任为目标导向，根据过程上的合规性受托责任和结果上的绩效性受托责任的理论要求，分别制定了预算管理目标和财务管理目标，并结合政府会计体系改革的趋势予以探讨，明确了我国建立双轨制政府会计系统（预算会计系统和财务会计系统）的要求，分析两者职能上的区别和业务上的联系，特别地，针对基金会计主体在我国的适用性进行探讨，最后重点探讨政府会计主体在两大系统中的具体设置问题，以期为政府会计改革提供有益的借鉴。