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中药是中华民族经历漫长历史发展而保存下来的优秀瑰宝,是中华民族防病治病的有效方法。但由于历史的局限,中医理论对中药的治疗作用往往停留在经验的总结和宏观的描述,缺乏科学试验的解释和验证。运用现代科学理论和技术手段,尤其是高效液相色谱-质谱联用技术(HPLC-MS)是研究中药药代动力学及其代谢物分析鉴定的主要工具,尤其是发挥其串联质谱(MS/MS)或多级质谱技术(MSn)的功能,可获得大量、有效的结构信息,有望建立快速、高效的分析研究体系。大黄药材来源于蓼科(Polgynoaceae)大黄属(Rheum)掌叶组植物的干燥根和根茎。具有泄下、抗菌、抗肿瘤、抗高脂血症,降低血压、健胃、利胆、保肝、强心、消炎、延缓衰老、调节免疫等作用。黄蜀葵(Abelmoschus manihot (L.) Medic. [Hibiscus manihot L.])为锦葵科(Malvaceae)秋葵属(Abelmoschus Medicus)一年生或多年生草本植物,其种子、根及花均可入药。近代药理学研究表明,黄蜀葵花提取物对肾炎、心肌损伤、脑缺血损伤等具有重要的药理作用,临床可治疗糖尿病和肾病。黄芩(Radix Scutellariae)为唇形科黄芩属(Scutellaria baicalensis Georgi)的干燥根。具有清热燥湿,凉血安胎,解毒功效。以黄芩提取物作为有效成分的双黄连口服液、复方黄芩胶囊、银黄片等,被广泛应用。本文通过HPLC-MS、MS/MS或MSn等方法,建立了大黄、黄芩及黄蜀葵三种中药多成分体内代谢研究、体内天然产物原型成分及代谢产物化学结构鉴定等快速高效的分析检测方法,包括药物样品制备、动物选择、剂量及给药时间确定、脏器组织及体液标本取材、生物样品前处理、HPLC-UV、HPLC-MSn等分析条件优化、生物样品检测、图谱分析、结构鉴定和数据统计等。在大黄水提物、醇提物大鼠口服含药尿总离子流图中共鉴定了18个化学成分,其中5个原型物质,13个代谢产物。在含药肾组织液与含药血清的HPLC-MSn图谱中分别鉴定出5个化学成分和3个化学成分,均为代谢产物。对黄芩水提物的化学成分进行了系统研究,通过HPLC-MS/MS分析鉴定得到48个化学成分。经中压ODS柱梯度洗脱以及半制备高效液相分离,得到7个化合物。利用HPLC-MS/MS对黄芩水提物、黄蜀葵醇提物大鼠口服含药尿进行了研究,在黄芩水提物大鼠含药尿中鉴定了9个化学成分,其中2个原型物质,7个代谢产物。在黄蜀葵醇提物大鼠含药尿中鉴定了9个化学成分,其中2个原型物质,7个代谢产物。通过上述研究,部分揭示了大黄、黄芩和黄蜀葵三种传统中药的药效成分,尤其是大黄体内药效物质,为进一步深入系统研究提供有价值的参考实例和方法学借鉴。