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实验目的:AGZY83a和Anip973是两株人类肺腺癌细胞系,Anip973是从AGZY83a分离出来,然而Anip973的转移潜能明显高于AGZY83a。应用基因芯片检测筛选Anip973和AGZY83a中的差异表达的基因,再从中筛选出于肿瘤转移相关的基因,筛选可能的肺癌转移分子指标,为靶向治疗药物开发和个体化医疗奠定基础。 实验方法: 1.细胞培养,培养AGZY83a和Anip973细胞系。 2.抽提以上两细胞系的总RNA,检测其质量,纯化,然后逆转录合成cDNA,利用全基因组表达芯片筛选出这两组细胞系表达的差异,从而得出两组细胞系差异表达的基因谱。 3.从差异表达的基因中选取4个基因进行实时定量PCR的验证,与基因芯片的结果进行对比,达到评估基因芯片的准确性。 4.通过GENEBANK检索以及PUBMED等数据库文献检索结合搜索GO分类,从差异表达的基因谱中筛选出与肺癌转移相关的基因。 实验结果:这两组细胞系筛选后筛选出差异表达的基因154个,其中上调的基因96个,下调的基因58个。实时荧光定量PCR验证,这些基因的表达趋势与基因芯片的结果一致。筛选出的差异表达的基因,通过GENEBANK和PUBMED等文献检索并结合GO分类,发现与肿瘤转移相关的基因共21个,其中上调表达的为15个,下调的基因共6个。 实验结论:通过基因芯片筛选,筛选出两组细胞系差异表达的基因。结果与实时荧光定量PCR验证的结果一致。在这两组细胞系差异表达的基因中,发现了多个肿瘤转移相关基因。