中药现代化是目前国内外医药界研究的一大热点。中药指纹图谱技术是中药现代化的有力工具，可以用来鉴别中药的真伪，控制中药质量及评价其安全性和有效性。中药指纹图谱的解析与处理通常借助于计算机，分析其化学成分测定值及相关的药理作用，快速、准确地寻找出内在规律，作为中药材质量控制的指标。由于中药是多种成分协同作用，所以图谱数据的整体性对研究至关重要。但是，在当前的研究中，有的在分析过程中打破了这一整体性，有的保证了数据的整体性却又直观性差，不易理解。因此，在中药指纹图谱的研究中，如何在保证图谱数据整体性的前提下实现分析过程的可视化是一个重要课题。本文基于多元图表示的理论基础，针对中药指纹图谱的数据处理问题，提出了一种可视化的模式分析新方法，实现了中药指纹图谱数据处理的整体性和可视性的统一，为中药的鉴别及评价提供了一种新的信息处理手段。主要研究了三个基本方面的问题：多元数据的多元图表示方法及特征提取方法；中药指纹图谱的雷达图分类模型的建立；标准指纹图谱的建立。1.研究了多元数据多元图的表示方法及基于多元图表示原理的特征提取方法。提出了多元数据的类间重叠系数矩阵以剔除方差大而分类信息差的向量；对传统散布矩阵进行了优化以区分类别均值与全局均值之间距离比较相近的向量；采用样本点与各个类别之间的距离表示样本点，再进行分类研究；对人机交互在多元图特征提取中的应用进行了研究。实验证明了这些方法的可行性及优越性。2.研究了基于雷达图表示原理的中药指纹图谱的分类。在多元数据雷达图表示及特征提取的基础上，将雷达图的重心图特征进行了拓展，并对相邻幅值比图特征进行了优化。针对中药指纹图谱的分类问题，提出了重心特征峰参数以及多层雷达图表示的分类模型。实验取得了较好的效果。3.研究了标准指纹图谱的建立。针对标准指纹图谱传统构建方法存在的问题，基于聚类原理，将多参数距离融合聚类规则作为标准指纹图谱。该方法以分类为目的，结果生成的不再是传统的有意义的特征指纹图谱或是特征库，而是一种分类标准。实验分析了该方法的可行性和优越性。4.利用近红外光谱仪分别获得了葛根（纯葛根粉及掺假葛根粉）以及不同种类的人参的指纹图谱，采用多层雷达图模型及相关技术对葛根的真伪及人参的种类进行了鉴别研究，结果验证了本文提出的可视化中药指纹图谱模式分析方法的可行性和有效性。